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最大爭議的是《蘇福省天國刑統》。《蘇福省天國刑統》是吉文元等而你按照《太平刑律》搞出來的東西，隨後蕭雲貴、左宗棠、王闓運等人都有刪改。左宗棠等人依照明律、清律等前朝律法做出的修改，而蕭雲貴、洪韻兒則是根據後世的律法修改，有些偏向西方律法。幾下一搗鼓，一部有些四不像的《蘇福省天國刑統》就出臺了。
太平天國定都天京後，在《十款天條》與《太平條規》的基礎上頒行了《太平刑律》。《太平刑律》將清廷為首的封建官僚、豪紳、惡霸視為‘妖‘，並奉行‘遇妖即除‘的方針，對內部謀反作亂、叛變通敵者給予最嚴厲的制裁；對擾亂社會秩序、貪汙盜竊、念習妖書、吸食鴉片者也予以嚴懲。《太平刑律》中規定的刑罰簡單殘酷，雖在一定程度上起到了維護新興政權的作用，但將所謂妖魔的範圍擴大，有時也失之於準確，更會把一些騎牆觀望的人推到滿清那邊。因此《蘇福省天國刑統》中首先就刪除了所謂妖魔的提法，蕭雲貴把戰爭罪犯、政治犯的概念引入，雖然有後世法典的意思，但卻廢了很多口舌才讓左宗棠這些人明白這些詞彙的意思。
因此《蘇福省天國刑統》被各官吏廣為詬病，提出了一千多條修改意見來。李壽蓉、許乃釗等儒生對此部法典立法的根基很有意見，他們認為當以禮為先，教化為主，禮教來源於風俗，草案照搬西方模式和太平那種不切實際的教義，罔顧中國國情。而且這部刑法背棄禮教，對於儒家三綱五常沒有保護，像一些忤逆父親、通jiān這樣明顯違背綱常名教的“犯罪行為”視而不見，其他的刑法又過於嚴苛，倒像是暴秦法家的那一套去了。
左宗棠、吉文元等人則認為《蘇福省天國刑統》廢除了凌遲、梟首等等酷刑，刑罰太輕，難以震懾罪犯，同時採用過多的新語，語義難懂。
“殿下，治亂世用重典，刑統過於寬和，不足以震懾宵小之輩。李壽蓉等人之語雖有道理，但禮教之事可放在太平盛世之事，三綱五常乃是法典根源，不可一舉推翻，否則世人之心難以收拾。屬下以為刑統當大修，內定人心，外具名望，寬赦天下當在我天國一統天下之後方可改行……”
在正殿上蕭雲貴和洪韻兒耐著xing子聽完左宗棠等人的話後，互相對望一眼，相視苦笑一陣，看來這刑統要得大修了，或許是兩人的想法太過超前了。
當下蕭雲貴便讓刑部重新審訂刑統，百官齊聲稱頌西王英明。
接下來便是接著討論《蘇福省科舉細則》、《蘇福省工商章程》、《蘇福省兵備章程》、《蘇福省農林茶絲章程》、《蘇福省拯危扶弱章程》、《蘇福省新學章程》、《蘇福省鹽鐵酒業章程》、《蘇福省教義細則》等章程。
《蘇福省科舉細則》當中衝擊最大的一條便是廣開科舉細目，農、工、商、醫等科目開設，意味著今後不是讀書人出身也能登堂考科舉了。以李壽蓉、許乃釗等儒家出身的官吏強烈反對起來，他們認為要是這些三教九流的人物都能參加科舉考試，登堂為官，便會傷了天下讀書人之心。
這引來堂上很多不是讀書人出身的將官反對，像西殿很多老兄弟都不是讀書人出身，他們大多數是農者、礦工、也有富商出身。
兩邊爭執起來，開始還好言相對，後來吉文元等人開口大罵李壽蓉、許乃釗等人是儒家餘孽。
蕭雲貴大怒，大聲喝止才將兩邊壓了下來，但他也看出來一個非常嚴重的問題，這就是西殿到底要不要尊儒教為國本的問題。此前雖然太平軍一直在弱化拜上帝教的影響，但畢竟太平軍是靠這個教義起兵的，就算他和洪韻兒再弱化，這個教義還是不能去掉。之前一直在征戰，軍中儒生等讀書人和信仰拜上帝教的老兄弟們都一起在為戰事努力，是以這個矛盾才壓了下來。但現在談到治國立政了，兩邊的矛盾自然會引發出來。
蕭雲貴這個時候才發現自己遺忘了這個大問題，看到兩幫人都互相敵視起來，這才覺得棘手起來。
洪韻兒急忙起身說道：“左相、六部首官、郡守、上海、寧波兩處軍政司首官留下，其餘人等暫退偏殿歇息！”
蕭雲貴大聲補充一句道：“適才爭執之語誰也不能再提一句，咱們一殿為臣，再有亂言擾亂人心者，當反叛論處！”。)
