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摩尼教是一個很複雜的宗教，它雜糅了祆教、基督教、佛教。朱元璋上位之後，對明教都採取了清剿。
更是徹底禁止基督教在大明帝國境內傳教；禁止三夷教在大明傳教。之後的基督教在整個大明帝國初期中期完全沒有了立足之地；傳教士基本絕跡。
直到，1583年9月傳教士利瑪竇與傳教士羅明堅進入大明帝國，在廣東肇慶建立了第一個傳教駐地，利瑪竇出版了第一份中文世界地圖，並用中文和傳教士羅明堅起草了第一部《祖傳天主十誡》。經過了幾次嘗試，利瑪竇和羅明堅沒能建立起新的駐地。羅明堅被教皇召回羅馬安排教皇使節去見中國皇帝，而利瑪竇和麥安東神父繼續留在肇慶。利瑪竇於西元1600年（萬曆二十八年）5月18日，利瑪竇帶著龐迪我神父和準備好獻給皇帝的禮物再度赴京，並於1601年1月24日抵達北京。進呈自鳴鐘、聖經、《萬國圖志》、大西洋琴等方物，得明神宗萬曆皇帝的信任。西元1601年，明神宗下詔允許利瑪竇等人長居北京。
利瑪竇透過向萬曆皇帝行賄，透過向官員行賄，透過向朝庭官員拉關係，不斷拉攏行賄大明朝庭的官員，之後被大明帝國的萬曆皇帝允許傳教併為之修建了教堂。
隨之有了徐光啟等天主教的在大明的三柱石，天主教在大明的傳教也順利起來。
但偏偏就是在天主教傳播事業起步剛剛順利幾年的情況之下，情勢徒然逆轉，出現瞭如此大的波折，這哪裡是
