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己的人才和熟練工人。
兵部還是掌管老職司，負責募兵、練兵，這部也加入了兩個新的司部。一個是鄉兵司負責統管蘇福省各地的鄉兵，其實也就是民兵武裝部的味道。另一個是參謀司，也就是負責制定全軍的戰略統籌、戰役計劃制定和戰局推演等職司。後來這兩個司部中走出了許多太平軍的名將來，因為講武學堂畢業的優等生會直接進入這兩個司部，歷練幾年後外放。
刑部除了掌管刑罰之外，蕭雲貴設立了監察司，主要就是負責監察百官的規行。同時刑部被剝奪了頒佈刑法的權利，刑部今後就只管查案、審案、斷案，蘇福省所有的法令皆有西王令的形勢直接頒佈。刑部多出的一個司部是警察司，也不是蕭雲貴偷懶，而是警察這個詞還是非常適用的，刑部掌管的警察司負責管理各地設立的警察所，就是負責維持地方治安。
工部的職司除了之前的興修水利、修橋鋪路、營造屋宇、宮殿、城垣之外，蕭雲貴新設了火器司、船舶司、機械司三個司部。火器司就是負責製造、研發各種火器、火炮、火藥的司部，該司部早在西殿東征前就存在，當時的西殿典匠們都被集中到一起，專門修繕火器和配製火藥，如今只是正式掛牌而已。船舶司的成立就有些倉促，雖然太平軍水師不少，但造船的工匠還是很少，民間招募了不少造船匠加入，但他們的工藝還停留在木帆船的階段。但蕭雲貴覺得這事要得一步一步來，先把架子搭起來，慢慢完善便了，稍後船舶司還會請洋技師加入，自然就會帶動自己的造船水平。同時船舶司還要該管內河航運往來的各種船舶，也算是江海事局的前身。機械司負責的事也不少，從礦產勘探到開採、冶煉，以及各種機械的製造等等。但這個司部和船舶司一樣，開始也只是個空架子。
第二百九十九章郡縣之制
西王府除去兩丞相、六部和六部所轄的三十六司之外，還有四個特殊的衙門和司部是直接隸屬西王娘管轄的。一個是洪韻兒早就管著的詔書衙，一個是女事館，一個輿宣司，還有一個是醫務司。
詔書衙所管之事也就是負責刊行西殿各種法令、文書和官方書籍，也負責民間各種書籍的刊行稽核，也就是西殿控制民間輿論的一個重要舉措。因為洪韻兒非常喜歡書籍的緣故，詔書衙暫由洪韻兒親領，其下有傅善祥、李璇璣等才女襄助。
女事館也就是管著西殿女營、女館等婦女之事，也是由洪韻兒帶著傅善祥、李璇璣、楊冬青等諸女執管。
輿宣司則是由王利賓任司長，職同檢點，就是負責開辦報紙，控制民間輿論，也負責各種宣傳之事。
最後的醫務司由姚遠出任司長，也就是負責蘇褔省的各種醫療、醫館和軍醫之事。
另外還有兩個部門也是由西王直接管理，一個便是新成立的情報司，由錢江主管，職同檢點；另一個是童強勝的白澤堂。情報司是西殿明面上的情報機構，除了負責探聽情報、收集民間訊息之外，還負責秘密監察百官，他們的職司和刑部監察司不同，他們只負責收集百官的情報，並沒有斷處和拿人的權力。而白澤堂則好像西殿秘密警察部隊一樣，除了刺探情報之外，還幹著一些見不得人的勾當，比如刺殺、造謠等等。因為這兩個部門極其要緊，所以也是蕭雲貴直管的。
由於西殿將官中過於偏重武事，武官倒是極多，而文臣終究太少，是以六部中的侍郎很多是由武職轉過來的將官擔任。而六部尚書則全是由文士擔任。
左宗棠為西殿左相，兼著戶部尚書的差事。華蘅芳任禮部尚書還兼著要籌備西殿科學院的差事，原本肖雲貴比較屬意李善蘭出任禮部尚書的，但這老頭潛心鑽研學術，無心出仕，也只得作罷，最後李善蘭答應幫著西殿開辦新式學堂或大學，他來做校長。李開芳轉為兵部尚書，還兼著管轄蘇州區的兵馬，也就是蘇州衛戍司令的意思。
吉文元出任刑部尚書。吉文元為人處事公正、鐵面無私，雖是武職出身，但他在軍中斷處案事，無有不服，出任刑部尚書也算合適。只是他的刑案斷處思路還停留在老舊的封建刑案思路上，講究重刑嚴厲。雖然和蕭雲貴的思路有些不同。但左宗棠呈言此刻正值亂世，之亂時用重典，吉文元的嚴酷正好適合，最後蕭雲貴才定了吉文元出任。
工部雖然有幾個司部還沒有侍郎出任，算是個空架子，但工部尚書是由徐壽出任。蕭雲貴也給徐壽特權，只要是徐壽找來的工學人才，西殿可以破格錄用。歷史上徐壽幫清廷辦的安慶軍械所、江南製造局等等就很有成就，加上徐壽乃是不可多得的工學人才。並無其他腐儒那種對洋人科
