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難，人類一度被逼到滅絕的邊緣。
在最危險的時候，只有一座城市的圍牆沒有被變異者攻破，倖存的人類減少到了不足一百萬。
只是，黑暗時代也給克拉拉與娜塔莎創造了機會。
在城市之外，克拉拉與娜塔莎聯合那些擁有超能力、能夠對抗變異者的超能力戰士建立了新的根據地，並且改變了做法，從一開始就把基地建在地下，以便避開那些主要在夜間活動的變異者。除此之外，還找來了很多的科學家，設法找到了一些科研裝置，重新開啟了科學時代。
正是克拉拉與娜塔莎的努力，人類文明守住了最後的堡壘，並且逐漸復甦。
有趣的是，在這個時期，入侵者沒有對付克拉拉與娜塔莎控制的抵抗組織，甚至暗中幫助抵抗組織對付變異者。只是在抵抗組織穩住了陣線之後，教會捲土重來，控制了城市，篡奪了抵抗組織的功勞。
與之前不一樣，克拉拉非常理智的選擇了退卻。
隨著人類的生存環境得到了保證，克拉拉與娜塔莎控制的抵抗組織離開了城市，離開了之前由他們保護的平民，並且從人們的視野中消失了，再也沒有去幹擾社會的正常發展，甚至很少與外界接觸。只是，抵抗組織一直在活動，一直隱藏在平民百姓裡，獲取資源，吸納新成員。
這個辦法，為抵抗組織爭取到了生存空間。
黑暗時代大約持續了兩千年，直到神聖歷三千年左右，舊大陸上的人口數量才恢復到了一億左右。
在此期間，抵抗組織一直在地下活動，在舊大陸上修建了十五座地下城市。
與張小剛他們建立的地下城市不同，抵抗組織的地下城市在地殼內，而且往往在某個城鎮下面，以城鎮為掩護。
更重要的是，抵抗組織沒有觸及入侵者的底線，即空間技術。接下來的幾千年裡，克拉拉與娜塔莎輪流統治著抵抗組織，在除了空間技術之外的其他科學領域投入了大量資源，甚至研製出了生產能量體的技術，只是很不成熟，即製造能量體所消耗的能量比能量體含有的能量還要多。至於人類文明，因為受到教會控制，所以始終處於矇昧狀態。經過數千年的淘汰，科學技術已經成為歷史，人類文明倒退了數千年，甚至上萬年。雖然幾乎失去了一切，失去了機會，但是人類文明還存在，沒有滅絕，也就沒有喪失希望。克拉拉與娜塔莎沒有反抗，她們在等待楚天疆歸來，在等待一舉擊潰入侵者的機會。
第二十三章 一線希望
看完霧影記錄下來的資訊，楚天疆沉默了。
雖然有一千五百多年的空白，但是楚天疆知道，在過去的幾千年裡，克拉拉與娜塔莎始終在堅持。讓她們堅持下去的是一個信念，一個人給她們的信念，而這個人就是遲遲沒有歸來的楚天疆。
楚天疆恨自己，恨自己沒有早點回來。
只是，楚天疆也知道，責任不在他的身上，因為在什麼時候從夢境中醒來，在什麼時候回到地球上，根本不由他決定。
“如果我在災難時代之前回來，會改變什麼嗎？”
“什麼也改變不了。”人影的回答很直接，也很冷酷。
楚天疆看著它，不知道該說什麼。
“一百年之後，沒人認識我們。我只是一名過氣的情報人員，你只是一名倖存下來、與普通人沒有差別的末日戰士。”人影淡淡一笑，說道，“當然，你比我重要，因為你會成為科學家的研究物件，但是你改變不了什麼。隨後幾百年的經歷足以證明，與你相關的那些東西根本不重要。就算我們在災難時代到來之前掌握了製造能量體的技術，只要在空間技術上沒有取得突破，我們就無法戰勝入侵者。相反，如果我們掌握了能量體技術，後果恐怕更加難以設想。”
“為什麼？”
“人在絕望的時候，什麼事情都做得出來。”
楚天疆鎖緊眉頭，思考著這句話的含義。
“這是一個非常淺顯的道理，只是很多人都想不明白。認清這一點之後，也就知道入侵者為什麼會在災難過去了四百多年之後才來到地球上，並且以救世主的身份出現，讓我們無從反抗。”
這下，楚天疆明白了過來。
如果入侵者一開始就直接入侵地球，人類將別無選擇，最有可能採取的辦法就是透過自我毀滅的方式與敵人同歸於盡。也許目的並不是同歸於盡，但是利用掌握的先進技術，最終結果很有可能是同歸於盡。這樣做，能夠粉碎入侵者佔領地球與奴役人類的企圖，可是同樣會導致人類滅絕
