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過自我進化，娜塔莎幾乎擁有了永久的青春，而且透過那些由她拯救的科學家，她把這種超能力移植給了克拉拉，讓克拉拉不再需要透過冬眠來抵抗時間，也讓克拉拉有更多的時間來管理與經營定居點。正是如此，在兩百多年裡，克拉拉與娜塔莎管理著定居點，在舊大陸上建立起了一個國家。
雖然這不是現代意義上的國家，主要是克拉拉與娜塔莎只能控制自己的城市，其他城市則以效忠的方式接受管制，但是在兩人的努力下，舊大陸正在恢復秩序，越來越多的人獲得了安全的生存環境。
最重要的是，科學技術得到發展，人類文明開始復興。
在“天使團”到來之前，舊大陸上已經出現了上百座城市，城市居民接近三千萬，此外還有大約相同數量的人生活在鄉鎮與農村裡面。在“超能力”軍團的圍剿下，舊大陸上的變異者正在迅速減少。
可惜的是，“天使團”的到來，改變了一切。
在那場殘酷的戰爭中，人類徹底敗北。克拉拉與娜塔莎不得不放棄城市，帶著倖存的超能力戰士逃到郊外，利用已經掌握的先進技術，開闢更加隱秘的生存空間，與入侵的敵人進行戰鬥。
事實上，與“天使團”相比，超能力軍團根本不值一提，即便是比以前更加強大的娜塔莎也毫無招架之力。
兩件極為關鍵的事情，改變了克拉拉與娜塔莎的命運。
一是張小剛領導的地下文明突然出現，讓“天使團”不得不集中力量對付這股掌握了更先進的科學技術，甚至已經在空間技術領域有所突破的人類文明，也就沒有繼續像克拉拉與娜塔莎這樣的逃亡者。利用張小剛他們爭取到的半年時間，克拉拉與娜塔莎在舊大陸腹地建造了第一座地下基地。
二是一項技術。這項技術，能夠把超能力戰士偽裝起來，讓他們在入侵者眼裡變得跟普通人一樣，或者說入侵者無法甄別出他們擁有的超能力，因此他們能夠混入人群，躲避敵人的追捕與圍剿。雖然第一座地下基地在一年之後就被摧毀了，但是利用這項技術，克拉拉與娜塔莎、還有少量抵抗者倖存了下來。
在隨後的漫長歲月裡，克拉拉與娜塔莎一直在秘密活動。
地下人類文明覆滅之後，入侵者沒有立即著手組建國家、政府等強制機構，而是透過教會來影響與控制人類。說得直接一點，入侵者並不關心人類社會的內部矛盾，在乎的只是人類是否會再次掌握先進科技。結果就是，舊大陸陷入了長期戰亂之中，國家與政府更迭，唯一不變的只有教會。
這種混亂的局面，大約持續了一千年。
在這一千年裡，出現了數百個國家，也出現了數個強大的帝國，但是隻要有任何國家敢於質疑或者是反抗教會的精神統治，都會在一夜之間被“天使團”剷除，然後引發更加嚴重的戰亂與混亂。
長期的戰亂，導致人口急劇減少。
到戰亂結束的時候，舊大陸上的人口總量已經不到一千萬。大量城市被廢棄，倖存者集中在幾座主要城市裡面，而且這些城市相距遙遠。由此導致的結果就是，各個城市之間的交往幾乎徹底斷絕。
人類文明由此進入了黑暗時代。
這是一個不堪回首的時代，更是一個斷裂的時代。
在此之前，還有不少人知道災難之前的歷史，知道人類文明取得過的輝煌成就，而且這些人一直在以各種各樣的方式，傳承著人類文明，把歷史告訴後人，給後人留下奮鬥的目標與理想。
可是在這個時代，人類文明徹底斷裂了。
在黑暗時代，活著的所有人都只有一個目的：不惜代價的活下去。
雖然從根本上講，黑暗時代的根源在入侵者身上，但是這個時代與入侵者、以及入侵者扶持建立的教會沒有直接關係。引發黑暗時代的原因是之前持續了一千年的戰亂，以及由戰亂導致的人口銳減。
黑暗時代到來的時候，在面積超過兩千萬平方公里的舊大陸上，人口還不到一千萬！
這是個什麼概念？
即便除掉位於北極圈裡的極寒地區、還有低緯度地區的沙漠與荒漠，在可供人類生存的大約一千萬平方公里土地上，人口密度還不到一平方公里一人。災難時代到來之前，亞歐大陸上有接近一百億人！
人口銳減，直接導致社會生產力降低。
為了生存，為了對付各種各樣的變異者，人們不得不放棄一些東西，比如在短期內見不到成效的科學技術。
最初的五百年內，倖存者的日子極為艱
