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時對民間借貸進行管理；原幕府金融司司丞徐萍留用。
下設府庫司：管轄和儲備各種戰略物資，並且根據朝廷的實際需要進行調撥和記錄；原幕府府庫司司丞何信留用。
下設稅務司：負責大明各種稅賦的制定、徵收、減免等事宜，負責大明商稅的徵收事宜。
下設海關司：負責大明對外貿易關稅的徵收。
在劉君韜設計的財政部體制中，還要承擔包括大明銀行的管制、新的稅制、士紳一體納稅和原始發票的推行、推行結合大明實際情況的土地承包所有制等一系列的大舉措。
當然為了減少阻力，這些新政在一定程度上也是承認現有大地主、大豪強、大士紳的部分利益，並沒有全面推翻重來。
增加教育部：掌管大明各地正在陸續籌建之中的新式學堂、軍校，組織大明每年的升學考試、結業考試，以及三年一次的科舉考試，為大明提供各種人才；同時，教育部還會開設各種技能考試，為各種能人辦法朝廷公認的證書。
原幕府民部教化司司丞郭昌敬留任教育部司丞。
增加監察部：劉君韜將原都察院、六科給事中等御史言官衙門全部合併到監察部中，負責對大明各級官吏進行督查，一經發現違法事宜，負責向法堂提出彈劾。
增加法堂：負責大明的司法審判，並且在大明各省、府縣設立獨立的法院，專門審理各種訴訟，不受大明各級衙門的管理，法堂與各地法院直屬於大明皇帝。
原幕府法堂司司丞康銘留用。
增加醫護部：負責大明各地正在籌建的醫館的管理，並且負責大明醫藥的研發、使用，負責對抗大明各地的瘟疫等醫學事務。劉君韜還將太醫院也併入醫護部之中，原幕府醫護司司丞岑熵留用。
增加中情部：負責大明內、外情報的蒐集、核查、匯總上報。
下設坊間司、朝堂司、番邦司，分別對民間、各級官府、外國的情報進行搜查，原幕府情報部司丞劉尚、劉忠、劉夏、郭翼分別出任司丞和副司丞。
同時，劉君韜將南、北鎮撫司衙門全部併入了中情部，原幕府情報部部長劉子安出任中情部部長，原北鎮撫司指揮使出任副部長。
增加贊畫部，專門就大明內外時局為劉君韜和成化帝提供建議。原幕府贊畫部部長張玉清出任部長。
下設戰略司：負責大明整體軍事戰略的制定，以及對各方勢力的軍事態勢的制定，由原幕府戰略司司丞趙凌出任司丞；
下設參謀司：負責大軍出征的臨場謀劃，以及提供各種計策參考；並且對大明出~臺的各項政策進行甄別和完善，由原幕府參謀司司丞趙炳義出任司丞；
下設檔案司：負責收集各種戰略、歷史、情報資料，並且存檔備查，為戰略司和參謀司做出決斷提供資料支援，由原幕府檔案司司丞曹繼旺出任司丞；
此外，劉君韜將原幕府中樞部的文案司、政令司、發展司的司丞、人員，全部充實到內閣之中，這三個司全部作為內閣的下設部門，原幕府中樞部司丞楊啟凡、賀之命、陳瑞全部留任司丞。
至於原六部眾官吏，劉君韜則是組織了一場聲勢浩大的考核，對這些官吏進行評審，凡是能夠考取優秀的官吏，全部充任到各部各司擔當副司丞、督給事中、左右給事中與給事中，其餘考核合格者，全部遷往南京任職，剩下不合格者全部裁撤！
這場聲勢浩大的革新中，劉君韜麾下的各所演武堂學院大放異彩，大批的新式人才被派往全國各地協助地方官府進行變法、革新，同時劉君韜動員各地將領、總兵官主抓軍隊變革，下令在大明軍中全面推行火器，開始在全國範圍內仿效天策軍的模式和編制，編練大明新式陸軍、新式海軍。
對於劉君韜的這些政令，成化帝全部予以批准，盡全力給予支援，讓滿朝文武和天下臣民都為之側目。
一時間，整個大明就好像是一座盛滿水的巨大青銅鼎，在烈火的不斷炙烤下，瞬間沸騰了起來。
已經在山東和山西實行二十年的天策軍模式，開始在整個大明境內全面推行！
