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一理論，並在1935年關於冰的摘值的論文中集中運用了這一理論。
現在莫斯基的變性實驗使鮑林進一步確信，氫鍵是蛋白質結構中一個重要的成分。1935年秋天，他們兩人根據鮑林的思路初步提出了一種新理論。他們寫道：“我們對一個自然的蛋白質分子（表現出一定的特性）的認識如下。分子包含一個多肽鏈，在整個分子中連續不斷（或者在某些情形下，包含兩條或更多的多肽鏈）；這一多肽鏈被摺疊為由氫鍵鍵合的唯一的結構。……”換句話說，所有蛋白質都包含氨基酸環，以及可能以阿斯特伯裡認為的原始蛋白質角蛋白形式存在的多肽鏈。強肽鍵使整個鏈成為一個整體，但是各部分之間較弱的氫鍵摺疊之後使整個鏈成為其最終的形狀。這最終的形狀對蛋白質的功能是至關重要的；分子除非保持這一形狀，不然難以完成其功能。稍微受熱之後，氫鍵斷裂，整個鏈條伸長，並像針線盒中鬆散的紗線那樣糾結在一起。然而，只要整個鏈還是一個整體，在合適的條件下，氫鍵能夠重建，蛋白質也能恢復原先的形狀和活性。較強的處理將使鏈本身斷裂，打破肽鍵，並不可逆轉地使蛋白質變性。
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