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同一地方內的所有生物已經彼此適應得很好了，除非經過長久時間之後，由於某種物理變化的發生，或者由於新型別的移入，在這自然機構中是沒有新位置的。還有，具有正當性質的變異或個體差異，即某些生物所賴以在改變了的環境條件下適應新地位的變異，也經常不會即刻發生。不幸的是我們沒有方法根據時間的標準來決定，一個物種的改變須要經過多長時間；但是關於時間的問題，以後一定還要討論。
古生物標本的貧乏
現在讓我們看一看我們最豐富的地質博物館，那裡的陳列品是何等地貧乏呵！每一個人都會承認我們的蒐集是不完全的。永遠不應忘記那位可稱讚的古生物學者愛德華·福布斯的話，他說，大多數的化石物種都是根據單個的而且常常是破碎的標本，或者是根據某一個地點的少數標本被髮見和被命名的。地球表面只有一小部分曾作過地質學上的發掘，從每年歐洲的重要發見看來，可以說沒有一處地方曾被十分注意地發掘過。完全柔軟的生物沒有一種能夠被儲存下來。落在海底的貝殼和骨骼，如果那裡沒有沉積物的掩蓋，便會腐朽而消失。我們可能採取一種十分錯誤的觀點，認為差不多整個海底都有沉積物正在進行堆積，並且其堆積速度足夠埋藏和儲存化石的遺骸。海洋的極大部分都呈亮藍色，這說明了水的純淨。許多被記載的情形指出，一個地質層經過長久間隔的時期以後，被另一後生的地質層整個地遮蓋起來，而下面的一層在這間隔的時期中並未遭受任何磨損，這種情形，只有根據海底常常多年不起變化的觀點才可以得到解釋。埋藏在沙子或礫層裡的遺骸，遇到岩床上升的時候，一般會由於溶有炭酸的雨水的滲入而被分解。生長在海邊高潮與低潮之間的許多種類動物，、有的似乎難得被儲存下來。例如，有幾種藤壺亞科（Chthamalinlae，無柄蔓足類的亞科）的若干物種，遍佈全世界的海岸岩石上，數量非常之多。它們都是嚴格的海岸動物，除了在西西里（Sicily）發見過一個在深海中生存的地中海物種的化石以外，至今還沒有在任何第三紀地質層裡發見過任何其他的物種：然而已經知道，藤壺屬曾經生存於白堊紀（Chalk period）。最後，須要極久時間才堆積起來的許多巨大沉積物，卻完全沒有生物的遺骸，我們對此還不能舉出任何的理由：其中最顯著的例子之一是弗裡希（Flysch）地質層，由頁岩和沙岩構成，厚達數千英尺，有的竟達六千英尺，從維也納到瑞士至少綿延300英里；雖然這等巨大岩層被極其仔細地考察過，但在那裡除了少數的植物遺骸之外，並沒有發見任何其他化石。
關於生活在中生代和古生代的陸棲生物，我們所蒐集的證據是極其片斷的，這就不必多談了。例如，直到最近，除了萊爾爵士和道森博士（Dr。Dawson）在北美洲的石炭紀地層中所發見的一種陸地貝殼外，在這兩個廣闊時代中還沒有發見過其他陸地貝殼；不過目前在黑誅羅紀地層中已經發見了陸地貝殼。關於哺乳動物的遺骸，只要一看萊爾的《手冊》裡所登載的歷史表，就會把真理帶到家中，這比細讀文字還能更好地去理解它們的儲存是何等地偶然和稀少。只要記住第三紀哺乳動物的骨骼大部分是在洞穴裡或湖沼的沉積物裡被髮見的，並且記住沒有一個洞穴或真正的湖成層是屬於第二紀或古生代的地質層的，那末它們的稀少就不足為奇了。
但是，地質紀錄的不完全主要還是由於另外一個比上述任何原因更為重要的原因；這就是若干地質層間彼此被廣闊的間隔時期所隔開。許多地質學者以及像福布斯那樣完全不相信物種變化的古生物學者，都曾力持此說。當我們看到一些著作中的地質層的表格時，或者當我們從事實地考察時，就很難不相信它們是密切連續的。但是，例如根據默奇森爵士（Sir R。Murchison）關於俄羅斯的鉅著，我們知道在那個國家的重疊的地質層之間有著何等廣闊的間隙；在北美洲以及在世界的許多其他地方也是如此。如果最熟練的地質學者只把他的注意力侷限在這等廣大地域，那麼他決不會想像到，在他的本國還是空白不毛的時代裡，巨大沉積物已在世界的其他地方堆積起來了，而且其中含有新而特別的生物型別。同時，如果在各個分離的地域內，對於連續地質層之間所經過的時間長度不能形成任何觀念，那麼我們可以推論在任何地方都不能確立這種觀念。連續地質層的礦物構成屢屢發生巨大變化，一般意味著周圍地域有地理上的巨大變化，因此便產生了沉積物，這與在各個地質層之間曾有過極久的間隔時期的信念是相符合的。
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