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或種族歧視。司法部提起公訴，以終止聯邦資助的醫院內的種族隔離。它彙編了“法庭之友”簡報，反映就業和公共食宿待遇方面的非種族歧視的情況，還對全國各地的警察暴行提起了公訴。
在這些行動中，有些是悄悄地進行以減少抵抗，有些則是大吹大擂進行以儆戒效尤，有些是為了應付危機的，有些則是為了促成進步的。總統仍舊在尋求著最不致造成分裂的途徑——而種族隔離的壁壘則逐步地被夷平了。
密西西比州
1962年秋天，總統優先處理了另一個種族事件。這個事件起因於黑人詹姆斯·梅雷迪斯申請進入全是白人學生的密西西比大學所發生的對抗。它最終不可避免地使密西西比州和聯邦也發生了對抗。這件事當時被稱為內戰結束以來州同聯邦當局發生的一次最嚴重的衝突。它的順利解決不僅維護了平等權利這項原則和法律的尊嚴，而且還維護了總統的最高權力。
一年多以前，梅雷迪斯就打算註冊進入他的家鄉州奧克斯福德地方的這所由納稅人出資維持的公立大學。一長列的法院裁決，包括最高法院的裁定，全命令准許他入學並結束地方官員的阻撓活動。可是公然的違抗卻以一個世紀以來空前未有的方式繼續著。這時，第五巡迴區聯邦上訴法院——由八名南方法官組成——判定密西西比州州長羅斯·巴尼特和副州長保羅·約翰遜由於阻撓梅雷迪斯入學而犯有蔑視法庭罪。法官們在忍無可忍的情況下，指示聯邦政府強制執行法庭的判決，並鎮壓一場近乎叛亂的行徑。
總統和司法部長承擔了這個責任，穩步地、謹慎地採取行動來對付這個事件。他們希望在聯邦中種族隔離最嚴重、偏見最深的這個州里避免使用武力或引起暴力行為。他們希望不使州長巴尼特變成殉道的英雄。當時外間謠傳他打算同比較有頭腦的、說話溫和的約翰·斯坦尼斯競選參議員。他們希望勸說密西西比州的官員——最後也勸說大學的行政人員——和平地、負責地按法律行事。最後，他們希望證明在不採取行動和採取使用聯邦部隊這一行動之間，可以採取許多其他的步驟——包括使用專門應付這種局勢而受過特別訓練的少數、許多、甚至整個中隊的聯邦執法警官（包括代理執法官、邊境巡邏警察和聯邦監獄警衛隊）。
1962年9月下旬，形勢急轉直下。在這個月的最後十天裡幾乎每天都作出了新的努力——在法庭上，在大學裡，在州立大學董事會中，在州長辦公室或是在同州長私下通的電話中。陪同梅雷迪斯的執法警官人數逐天增加。同巴尼特的談話一次比一次尖銳。鮑勃·肯尼迪和卓越的司法部副部長伯克·馬歇爾領導著這場鬥爭，這就再次突出地說明了巴尼特所藐視的不是約翰·F·肯尼迪，而是美國政府的尊嚴。
到9月30日星期天，巴尼特終於認識到難逃的後果。總統釋出了一項宣告和一道行政命令，準備把密西西比州國民警衛隊置於聯邦政府的權力之下並部署一些其他的部隊。他宣佈將在星期天晚上透過電視向全國發表一篇演說。巴尼特在同司法部長和總統的一系列秘密電話商談中，提議允許他英勇地站在校門口，等執法警官的槍口對準他後再屈服。但這出小戲可能會冒風險，因為成群結隊的學生、縣司法官員、州警察以及每次發生這類衝突時總聚在一旁的幫手們可能會挑起一場暴力行動。州長仍然試圖顧全面子，於是提議在那個星期天總統發表演說之前，迅速地、悄悄地把梅雷迪斯送進校園。由於人們以為總統的演說將宣佈聯邦政府準備在星期一採取的行動，而奧克斯福德的校園在週末又是空空蕩蕩的，州長便可以佯裝不知，然後從傑克遜市他的辦公室裡發出激烈的抗議。巴尼特答應，一支龐大的州警察力量會保證梅雷迪斯的安全，不需要國民警衛隊或其他部隊。肯尼迪弟兄同意了這個計劃，認為這是避免逮捕巴尼特和部署一支武裝部隊的手段，但他們又不想完全相信巴尼特的諾言，於是把部隊駐在孟菲斯以保持警戒，並給保護梅雷迪斯的助理執法警官配備了鋼盔和催淚彈。
我到達白宮時，發現總統——陪同他的有司法部長、馬歇爾、奧唐奈和奧布賴恩——在內閣會議室裡來回踱步，那裡同奧克斯福德保持著直線的電話聯絡。總統預定在星期天晚上七時半發表演說，在此時刻之前，梅雷迪斯在州警察和大學行政人員的護送下，已經乘車安全到達了校園裡的一個男生宿舍。但是總統對巴尼特的保證仍然有些懷疑，他對他的弟弟說：“我們不能聽任梅雷迪斯的生命冒險，或者聽其自然，使聯邦政府顯得很愚蠢。”他把演說推遲到晚上十點鐘發表。國內發生暴力行動的可
