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植物製品）六部；
動物界——蟲、鱗、介、禽、獸。最後列人部，共六部。
這種分類原則有深刻的哲學思想作指導。《本草綱目·凡例》闡述其指
導思想說：“首以水、火，次之以土，水火為萬物之先，土為萬物之母也。
次之以金、石，從土也。次之以草、谷、菜、果、木，從微至巨也。次之以
服器，從草、木也。次之以蟲、鱗、介、禽、獸，終之以人，從賤至貴也。”
在無機物中，先列水、火，而不先以玉石，符合金元以來醫學界五行尊
水火的基本觀點。水火對維持生命最為重要；其次是土，人和萬物生長都靠
土。金石出於土中，故應列於後。
在植物中，草、谷、菜屬本草，果、木屬木本，表明先有低階植物，後
有高階植物，即“從微至巨”。服器屬於草木製品，歸屬於後，理所當然。
在動物中，由蟲到獸，從無脊椎到有脊椎，由低階動物到高階動物。人
居最後，從生物學上看是最高等的動物，此即“從賤至貴”的原則。這種排
列次序，實質上包含著生物進化論思想因素。16 部分類，只是一個大綱。每
一類仍過於龐雜，例如草部共有439 種（附錄、有名未用除外），仍不易掌
握。李時珍進而創立60 類分類法，每部之下，再細分若干類，使綱目更加清
晰。
60 類的名稱和它所屬的部如下：
①水部——天水、地水 2 類
②火部——火類 1 類
③土部——土類 1 類
④金石部——金、玉、石、滷石 4 類
⑤草部——山草、芳草、隰草、毒草、蔓草、水草、
石草、苔草、雜草、有名未用 10 類
⑥谷部——麻麥稻、稷粟、菽豆、造釀
（指穀物製品） 4 類
⑦菜部——葷辛、柔滑、蓏菜、水菜、芝栭 5 類
⑧果部——五果、山果、夷果、味果、蓏類、水果6 類
⑨木部——香木、喬木、灌木、寓木、苞木、雜木6 類
⑩服器部——服帛、器物 2 類
虫部——卵生、化生、溼生 3 類
鱗部——龍類、蛇類、魚類、無鱗魚類 4 類
介部——龜鱉類、蚌蛤類 2 類
禽部——水禽、原禽、林禽、山禽 4 類
獸部——畜類、獸類、鼠類、寓類、怪類 5 類
人部——人類 1 類
有了60 類的劃分，人們對藥物類別的瞭解更進一層。草部的山草、隰草、
水草、石草，按草的生長環境劃分；芳草、毒草，按氣味、毒性劃分：蔓草
按形態劃分。果部的山果、水果，按生長環境劃分；蓏果，按性質劃分。木
部的喬木、灌木、苞木，按形態劃分；香木，按氣味劃分。禽部的山禽、水
禽，原禽、林禽，按棲息環境劃分。獸部的畜與獸，按家養與野生劃分。
按照60 類的劃分，知道藥物的名稱，就大體可瞭解其所屬部類；掌握了
部類，也易於檢索藥物。《本草綱目》自第5 卷至52 卷所載藥物，就是按這
種以部統類的綱目劃分的。
李時珍按照“析族區類”的分類原則，在類之下，還分有若干族。為了
避免煩瑣，書中沒有標明族的名稱。在植物類藥物中，這種族的歸納容易為
人所覺察。親緣關係相近的植物往往排列在一起。例如草部芳草類，廉姜、
山姜、豆蔻、薑黃、鬱金等屬姜科植物；草部芳草類，菊、野菊、艾、千年
艾、青蒿、白蒿、黃花蒿等都是菊科植物；果部山果類，梨、棠梨、木瓜、
山楂、林檎、枇杷、櫻桃等都屬薔薇科植物。
《本草綱目》中植物藥居多，其中草部8 類，谷部3 類，菜部5 類，果
部6 類，木部5 類。五部共計27 類（雜草、有名未用、造釀、雜木四類未計
人）。五部27 類的植物分類法，較之西方植物分類學鼻祖林奈1755 年創立
的兩類24 綱（顯花植物、隱花植物兩大類，顯花植物中分單雄蕊、
