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20世紀80年代，澳大利亞的一組科學家完成了大量生化實驗，結果顯示中等量飲用咖啡對心臟是有益的。當時認為咖啡因是咖啡的主要成分，似乎具有消除某種可以引起血管堵塞導致心臟發病的內源性酶的作用。實驗推測，咖啡可以抑制血栓發展，有助於預防心臟發病，換句話說，就是抑制血管內血塊的形成。心臟病的一個決定性因素是纖溶酶原啟用物抑制劑（PAI）。這種人體內生成的物質如果大量存在就可以導致血栓症。咖啡因可以使PAI水平下降50％，因此減少心肌梗塞的危險。此外，咖啡因可以使血塊崩解的酶水平增加，這種酶被稱作組織型纖溶酶原啟用劑。每天或每隔一天攝入2到4杯咖啡，不超過400…500毫克的咖啡因，可以為機體提供抗氧化物質、奎尼內酯和礦物質，或許也有助於預防心臟病。
飲用2…4杯咖啡的良好習慣可以預防心臟病，這個假設還需嚴謹的臨床研究進一步證實。越來越多的資料顯示，確診抑鬱症的男性（而不是女性）可能會發生冠心病，這與糖尿病、高血壓和吸菸無關。抑鬱症患者與非抑鬱症患者相比，冠心病危險因素更多。另外，患了抑鬱症的人對嘗試改變冠心病的危險因素也漠不關心。抑鬱可能並不會直接引起冠心病，但是抑鬱會促進導致冠心病的行為。規律的中等量攝入適當烘焙後的咖啡可能是許多疾病如糖尿病和冠心
