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與各自神奇寶貝的關係，小智和其餘訓練家在目睹了超夢出於個人目的綁架了喬伊小姐後使用對超夢進行了挑戰。
漫畫迷們興奮的盯著熒幕，荷爾蒙不斷分泌，他們清楚重點就要來了，同時期待超夢以及那隻莫名出現的夢幻的實力。
超夢派出對應的克隆神奇寶貝，分別是妙蛙花、水箭龜和噴火龍，輕易的打敗了他們，並開始使用特殊的神奇寶貝球對其進行了收服。
小智追逐著四處躲避的皮卡丘來到了小島的深處，並發現、摧毀了克隆機器。爆炸使得所有克隆pm被釋放，與此同時超夢下令它的神奇寶貝大軍擊敗所有島上的人類。
小智出於激憤攻擊了超夢，後者將其推開並打飛，緊接著之前偶爾出現併為超夢所吸引的夢幻救了小智。此時訓練家們的神奇寶貝們與其克隆的野蠻戰鬥徹底爆發，但小智的皮卡丘拒絕爭鬥並訴諸於掌擊對手。即使超夢與夢幻厭倦了拉鋸戰，訓練家們仍舊無法容忍這種殘酷無情的暴力。
超夢的夢幻不斷髮起進攻，由於超夢是由夢幻的基因行成，兩者在能力和屬性上幾乎相當，一時間影子球、幻象術、保護和湯勺不斷進攻對方，可雙方間能力相當，短時間內無法解決對方（這裡我最想說的是，夢幻明明不比超夢差上分毫，可超夢的成長值卻明顯超過夢幻，僅次於創世神，而夢幻的成長值比三聖鳥好不了多少）。
為了速戰速決，超夢和夢幻積聚起所有剩餘的力量拼死一搏。但就在他們開火時，為了制止它們，小智勇敢地衝到場地中央試圖阻止戰鬥。兩者的致命一擊同時命中，小智化為石塊倒地不起。
“又來了！”
“主角又掛了！”
“小智這應該算是死了吧！”
“肯定掛了，這可是兩隻超神獸的大招，不過我想後面肯定會復活的！”
“第四個了！”
在小智石化的時候，漫畫迷們的心一下子提了起來，生怕小智真的死亡，不過他們明顯是操心�
