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以允許他出現在基地內，因此葛城美里不出意外的被滯留在了地表的偽裝基地中，在一名基地安排的工作人員的照顧下在南極玩，可也正是如此，讓她僥倖的成為了第二次衝擊之下的倖存者。在第二次衝擊所產生的‘淨化’中活了下來。
不過作為代價，就是親眼目睹了光之巨人和血海的誕生，以及其後三年的失語自閉生活，直到後來遇到身上有著她父親影子的加持良智。才漸漸的恢復過來。
隨後葛城美里開始調查真相，併為此進入軍隊，加入國聯，升格進秘密機關nerv……可以說也是直這個時候她才真正的知道了第二次衝擊的真相。並將使徒全員當成自己的殺父仇人，為此憎恨到現在。
“不過話說回來，你找到對付使徒的辦法了嗎？”接著。扭頭看向一邊的赤木律子問道。
“我還以為你不會問呢。”赤木律子微笑道。說著手腕一翻，將一張小磁碟遞給了葛城美里。
“還真的有哇。”葛城美里既詫異又開心的說道。
赤木律子笑了笑，沒有說什麼。
“不打擾你了，我去研究作戰計劃。”葛城美里連忙自椅子上站起身，一邊朝外走去，一邊說道。
“唰！”
“砰！”
只是還沒等她走出幾步，緊閉的辦公室房門便驟然打了開，然後一臉慌張的伊吹摩耶就衝進了辦公室中，重重的和葛城美里撞在了一起。
“摩耶？發生什麼事了，這麼慌慌張張的。”葛城美里抱住身體相對來說有些嬌弱的伊吹摩耶皺眉問道。
“戰，戰自……”伊吹摩耶急喘了幾口氣，連聲說道“戰自的人來了，說要接管我們nerv！”
“什麼！？”葛城美里表情一變，高聲說道。
與此同時赤木律子也是眉頭一皺，面色陰沉了下來。
“怎麼回事？”葛城美里急聲追問道。
“不清楚，不過好象是國防省那邊直接下達的命令，讓戰自接管nerv本部。”伊吹摩耶連忙回答道。
“混帳！我們nerv是國聯直屬的特殊組織，跟國防省完全沒有統屬，他們憑什麼命令戰自來接管我們！？難道他們想要造‘反嗎！？”葛城美里怒聲說道。
“不行！我要去阻止他們！”
說完葛城美里便將伊吹摩耶一鬆，快步走出了房間。
“美里！”赤木律子大聲叫道。只是終究慢了一步，只能眼睜睜的看著葛城美里消失在重新閉合的房門後面。
“前輩，怎麼辦？”伊吹摩耶看著自己所崇拜、仰慕、甚至抱有非份之想的赤木律子，慌聲問道。
“不用慌，做好我們自己的事就可以了。”赤木律子沉聲說道。
“這樣就可以了嗎？”伊吹摩耶追問道。
“恩。”赤木律子點頭確認著，然後突然手點虛空，在自己那由神經連結裝置所提供的特殊視界中操控起來，一邊向周朝傳送著nerv本部這邊出現的狀況，一邊透過賈維斯聯絡上magi主機，兼接下達了各項鎖死命令。以免‘戰自’的傢伙們不要臉，將eva收走。
“前輩，你在做什麼？”完全看不懂赤木律子行為的伊吹摩耶疑惑道。
“沒什麼。”赤木律子說著也從椅子上站起身，朝辦公室外行去。
伊吹摩耶見狀沒有遲疑，立刻緊跟了上去。
……
“三木少佐，你們這是什麼意思！？”葛城美里怒視著面前那名在兩名身穿日本‘戰略自‘衛隊‘軍服計程車兵保護下的平頭中年男子大聲喝問道。
“我們nerv乃是聯合國所屬組織！你們戰自的人無權入侵這裡！”
“無權不無權我不知道，我只知道國防省給我的命令就是佔領這裡，如果不想出現無所謂的犧牲，就立刻讓你的人收起武器，否則出現什麼擦槍走火的事情。可就不要怪我事先沒提醒過你了。”名為三木的軍官冷聲說道。
“國防省？笑話，我們nerv乃是和國防省同級的並行組織，國防省有什麼權利命令你們佔領這裡！？”葛城美里冷笑道。
“那就是你們和國防省的事情了，與我無關！我現在再重申一次，立刻讓你手下的人放下武器，接受我們戰自的管理，否則就休怪我們不顧念早前的情份了。”三木毫不客氣的說道。
“你！”葛城美里怒視著三木，卻半點也說不出話來。
“日向！”接著，葛城美里大聲說道。
“是！”一旁的日向立刻大聲回應
