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了保證有效的監督內閣，太平天國設立了民議院，這個民議院也就是各地平民百姓選出代表來，他們只負責在民議院中提出對國家政務、政策施行的好壞進行評判，最後將評判結果直接送交皇帝御前。皇帝透過民議院的動議來決定內閣的工作成果。這個民議院只是一個資訊收集、傳達的形式，並沒有直接罷免內閣的權力，也不參與內閣首相的選舉。不過這種民議院的選舉制度是為了將來內閣由民眾選舉出來在打基礎，同時也讓內閣有另一種約束。
內閣制度宣佈完之後。就是六部的改革，傳統的朝廷六部面對越來越多的事務已經嚴重阻礙了運作效率，六部下面的三十六個司部該管著國家一切的事務。包括軍隊、政府、交通、醫療、教育、外交、商貿、農業、工業等等，但每次司部有公務還要到六個部先轉一道手。這樣是非常影響效率的，而且也出現了大量的職責重疊的冗官。因此。這次太平天國直接取消了傳統的六部，直接將三十六個司抬升為國家中樞部委，成立了國防部、交通部、外交部、工業部、農業部等等，讓各個部門更加專業化。而原來的六部尚書、侍郎等人，一些直接到新的部委接任部長職位，一些則進入內閣。
除了以上政體改革之外，還有就是引人注目的軍隊改革，按照太平天國的新軍制，太平天國皇帝兼任太平天國三軍統帥，其下按照地域劃分成九大軍區，包括華東軍區、華南軍區、華中軍區、華北軍區、西北軍區、西南軍區、東北地區、新疆軍區和中樞軍區。傳統的中華地域上前面7個軍區都好理解，而新疆軍區單獨劃出來就是因為那裡還是翼殿的軍隊，而中樞軍區則是太平天國保證首都防衛力量的重要表現。
然後就是各個軍區內部軍隊的劃分，精銳的第一軍第二軍劃歸中樞軍區，其餘編練的三到十八軍則分別劃歸其餘七個軍區，新疆軍區則單獨由翼王統領。以上幾個軍區軍事主官每三年輪換一次，新疆軍區除外。
本來蕭雲貴還想設立一個海外軍區的，但這樣做擴張的意圖太過明顯，也怕帶來不好的外交影響，因此暫不設立，但在幾年後這個軍區還是設立了起來，而且是兩個，一個是南海軍區，一個是北疆軍區（外國人稱西伯利亞軍區）。
軍政的改制之後宣佈的又是另一項關於教育的重大改革，也就是廢除了幾千年來的科舉制度，太平天國開始實行全民三年義務教育制度和國家政務員考試製度。三年義務教育是太平天國為了降低全國文盲率而花費大量金錢和投入推行的一種普遍教育，預計三年內全國要新開辦小學三千多所，保證全國三千多個縣每個縣都有公立小學。因為還是國家人口太多和地域太廣的緣故，暫時只能推行三年義務教育，否則財政上的壓力還是太大了，因為這個義務教育是國家出錢，完全免費的。
而國家政務員考試製度則是更加開啟了普通人當官的渠道，只要你識字、有一技之長便可以參加每年舉行的政務員考試，和後世一樣，國家擇優錄取，先從地方政務幹起然後逐漸提拔到中央來。這樣能避免一群只會寫八股文的書呆子長期掌控著國家的政局，而真正做到了不拘一格降人才的選拔制度。
各種改革制度宣佈之後，原本太平天國的舊有朝臣們表現得比較平靜，這些改革他們是心底裡早就有數的了，很多制度之前他們都參與過討論，因此並不驚奇。而袁甲三、李鴻章、彭玉麟、慶豐等滿清降官們就覺得很是驚訝了。
當散朝之後，李鴻章走在宮內甬道上時對袁甲三和彭玉麟道：“觀我新朝氣氛，是在開啟中華三千年未有之新局面啊。”彭玉麟則道：“新皇是否放權太過？會不會出現明太祖之事？”彭玉麟所說的明太祖之事三人都明白，就是明朝初年朱元璋設立了左右丞相，但後來皇權和相權衝突，最後朱元璋又取消了丞相制度。
袁甲三沉吟半晌後道：“新皇乃開明之君，必定不會是朱元璋那種濫殺開國功臣之人，中華數十年之內，必能大治。”袁甲三的話只對了一半，蕭雲貴的確不是濫殺功臣之人，而他的妻子洪韻兒卻是。在二十年之後，蕭雲貴先因病駕崩離世，後來新皇繼位，面對當時國內資產階級想要掌握國政和傳統封建勢力的角逐之時，已經是皇太后的洪韻兒為了保證國家順利過渡，完成國家資本制度的改革，一口氣殺掉了包括袁甲三自己在內的十多位代表封建殘餘勢力的開國老臣子。不過也算幸運，洪韻兒殺功臣的時候，很多功臣已經老邁病逝的居多，所以殺的還不算太多。
而洪韻兒二十年後誅殺功臣支援資本制度改革則是另一場大變革，那時候國家已經具備了改革的條件，民眾的文盲率大幅
