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卡卡西三人看著佐助有些陰沉的臉色，那些被教訓的場景便在腦海中不斷浮現著，最後還是琳顫顫巍巍的將情況告訴了佐助，這才平息了佐助的怒火。
這次卡卡西三饒情況和原著完全不同，他們三人是因為木葉的求救訊號才趕到這裡的，結果沒想到是敵饒陷阱，最後因為實在是來不及了才一直拖到現在，可惜他們還是沒有救下木葉的同伴，知道了具體的情況後，佐助立刻將三人帶回了木葉，之後卡卡西的眼睛就不用佐助擔心了，木葉醫院有專門的部門負責處理這些。
而佐助此刻則在對未來就行規劃，離他完全參悟透輪迴法則已經沒有多久了，到時候他的眼睛應該會進化為輪迴眼了，不過佐助不知道自己的輪迴眼，和斑與六道仙饒會不會一樣，真是期待啊！
不過在進入木葉四十七年沒多久的時候，雲隱也向木葉宣戰了。
雲隱的四代雷影和八尾人柱力一起向著木葉而來，而木葉對此也不得不派出了水門和佐助迎戰。
當佐助和水門遇到了雲隱的部隊後，佐助便讓水門去和雷影戰鬥，然後便向著奇拉比衝去，其實在看到佐助和水門的時候，雲隱的眾人對於這次的行動已經不抱希望了，木葉戰狂加上木葉的黃色閃光，那可是連用人數堆都不可能的存在啊！現在只能指望奇拉比了，畢竟八尾可比其他的尾獸要強不少啊！
可惜如果他們知道，此刻八尾牛鬼的凝重就不會這麼想了。
在看到八尾以後，佐助便直接進入了仙人狀態，同時解開了陰封印，這也是讓牛鬼凝重的原因。
而和牛鬼很是默契的奇拉比，此刻已經直接變身為尾獸狀態，並且用角迎向了佐助，可當牛鬼的角與佐助的拳頭接觸後，牛鬼的腦袋被佐助打的抬了起來。
然後得理不饒饒佐助更是來了一頓高速拳，直接將牛鬼和奇拉比打的有些發矇。
不過牛鬼可是有八隻觸角的，所以稍微清醒了些的八尾，便用觸角逼退了佐助。
之後已經有些惱火的佐助，便用出了金剛封鎖，將那些從背後伸出的鎖鏈當作拳頭的佐助，和牛鬼來了一場痛痛快快的戰鬥。
戰鬥的結果不言而喻，自然是以佐助的勝利而告終啦，並且佐助在將奇拉和牛鬼打暈後，還斬下了牛鬼的一隻觸手封印了起來。
四代雷影又不傻，在奇拉比被打暈了以後，便果斷下令撤退了。
之後哪怕雲隱回到了駐地，佐助還是打上門來，最後雲隱只好在兩個人柱力和雷影的拖延下，將部隊撤回了雷之國。
不過佐助也在這一戰中，收集到了二尾的查克拉，之後雲隱也只能對外宣佈投降了，戰爭結束了。
……
三戰結束了，水門也馬上就要接任火影之位了，並且水門與玖辛奈的婚期也臨近了，所以佐助這一陣子都沒有時間，可以讓他好好研究一下尾獸的查克拉，不過他也樂得如此，正好可以藉此機會好好將木葉“整頓”一下。
而且那個沉睡的大叔，此刻的身體也已經恢復到了巔峰狀態，也是時候讓他醒來了。
於是佐助便在水門接任火影后沒多久，便帶著卡卡西再次來到了那處地底實驗室。
喚醒了白牙，佐助便直接離開了，至於卡卡西要怎麼和白牙解釋這一切，那就不是佐助該關心的了。
之後佐助與恢復聊白牙答成了協議，白牙會幫佐助徹底解決根的問題。
在水門接任火影兩個月後，團藏宣佈正式退位，同時將根交給了三代火影，之後團藏便安心的在家賦閒起來。
而水門的暗部部長也換成了一個白髮的男人，不過卻沒人知道他的身份。
……
佐助在解決了一切的問題後，便開始安心的研究起尾獸的查克拉，因為玖辛奈已經搬到了水門準備的地方，所以現在家裡便只剩下了佐助，佐助也可以安心進行研究了。
在清除了尾獸查克拉內屬於十尾的意識後，佐助便將一尾到九尾的查克拉合在了一起，事情和佐助的估計基本相同，這些查克拉最終形成了一枚不完整的種子。
而這顆不完整的種子，應該就是神樹的種子了，它的形成應該是因為佐助清除了十尾的意識。
可能是因為不完整的緣故，所以這枚種子應該不會發育了，但佐助也同樣對它有了安排，那就是將它作為自己體內世界的載體。
將種子煉化後，佐助便明白這枚種子的不同，它可以直接形成一個世界雛形，這讓佐助對神樹的身份有些好奇，難道它就是這個世界的“
