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蛋了，於是大臣們立刻跟在了天皇的身後朝著地下研究所前去，然而天皇對著大臣們說：“你們家中也有你們的家人，你們現在快點回去保護你們的家人吧，帶著他們到避難區去躲避吧，而且會有戰士操縱機械哥吉拉去戰鬥的，現在這座城市我下達最後的命令，所有的戰士和忍者立刻前往南城去阻止哥吉拉的到來。”
大臣們聽到天皇這樣說在心中也是感激不已，因為他們家裡確實還有需要他們保護的人，於是大臣們對著天皇彎腰行禮說：“是，我們現在就去釋出最後一道命令，還請天皇保重，希望機械哥吉拉能夠打敗那隻巨大的哥吉拉。”
天皇點點頭就再也沒有回頭，天皇帶著自己身邊的忍者來到了地下研究所，地下研究所就在東京廣場的地下百米之處，在那裡按照東瀛天皇的命令在研究著造神計劃，由於百年之前的造神計劃失敗之後這專案就停止了，天皇繼位之後天皇就修改了這項造神計劃的專案，他們把研究古代人與動物精華結合的技術改造成了製造出機械哥吉拉的計劃，他們知道幾百年前就有哥吉拉入侵東京的案例，因此這個新天皇為了避免這一天的到來才製造了這個機械哥吉拉，地下研究人員見到天皇的到來之後就對著天皇行禮，然而天皇對著他們說：“大家就免禮了，現在是我們東京城危機關頭，你們立刻將機械哥吉拉拉到遞上去，因為哥吉拉已經到來了，養兵千日用在一時就是這個時候了，現在我們也將最後的希望全部寄託在這個機械哥吉拉身上了。”
天皇說出了這些話之後研究人員也感覺東京的末日到來了，之前他們就發現了橫濱城的爆炸了，雖然沒有完全影響到東京，可是即使這麼遠的距離還是被一股威力非常大的衝擊波影響到，科學家們聽到了天皇的話之後就立刻把機械哥吉拉的開關解鎖了，並且將巨大的哥吉拉送上了地面上準備和巨大的哥吉拉進行最後的殊死搏鬥。
這時候整個地下研究所頓時就開始準備起來了，而機械哥吉拉也從巨大的倉庫之中拉出來了，現在的機械哥吉拉被地下巨大的升力機慢慢地往上面提升著，當巨大的機械哥吉拉到達地面上之後這才知道機械哥吉拉到底有多巨大，因為後機械哥吉拉身後的大廈做參照對比，現在的機械哥吉拉的身軀就和百米多高的大廈差不多，並且在機械哥吉拉內部的操作室之中有戰士已經在裡面準備操縱哥吉拉了。
然而這時候發出了一串串的訊號說：“機械哥吉拉能量填滿，可以進入戰鬥狀態，哥吉拉已經升到地面上，可以開始戰鬥。”
這個戰士現在正在等候東瀛天皇最後的命令：“請天皇陛下下達最後的指令是否現在開始戰鬥？”
天皇這時候看著大螢幕上的戰士說：“很好，山本一郎，東京城能不能存在就靠你了，加油！現在你就去戰鬥吧！”
山本伊朗聽到了天皇的指示之後立刻對著天皇行了一個軍禮，並且操縱者機械哥吉拉朝著哥吉拉的方向過去，這時候在機械哥吉拉的背後頓時出現了火箭發射系統和平衡操縱裝置，然而這時候山本頓時操縱著機械哥吉拉大喊了起來：“機械哥吉拉啟動！”
霎那間從巨大的機械哥吉拉的背後發出了一股非常巨大的藍色火焰，並且巨大的力量頓時就將這隻非常龐大的機械哥吉拉託了起來，並且機械哥吉拉調整了一個角度之後就朝著哥吉拉前進的方向飛過去。
然而機械哥吉拉身後的藍色火焰正是核能的力量，這隻哥吉拉經過過去的戰鬥情況之後又重新對機械哥吉拉作出了改造，在身軀上不但變得更加巨大，而且在能量上由電力系統直接改成了核能系統，這樣就可以和那隻非常巨大的哥吉拉抗衡了。
而這時候這隻非常巨大的哥吉拉已經進入了東京城了，然而他也感知到了東京地下研究所方向強大的核能，並且還有一隻擁有著高濃度的核能正在朝著哥吉拉的方向過來，哥吉拉知道有強敵出現了，於是哥吉拉就在城市大樓之間等待著那個強敵的到來。
這時候哥吉拉看到空中飛來了一個和自己身軀差不多大的銀色機械哥吉拉，哥吉拉能夠明確的感知到這隻機械哥吉拉的身上有著非常強大的核能力量，而機械哥吉拉現在也降臨到了哥吉拉的面前，想在兩隻巨大的怪獸正在針鋒相對著。
沐風和李元徹三人解決掉了核能反應堆之後也飛到了這附近最高的大廈頂端看著這兩個強大的怪物的戰鬥，而看著這裡戰鬥的還不止是他們，現在東瀛天皇和大臣們東京城和東京城附近的人們都在關注著這場驚世對決，哥吉拉和機械哥吉拉的對決。
東瀛天皇在地下研究所看著山本說：“你一定
