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就這樣，出現了日本幕府大將軍帶著一群家老投降的一幕。
負責征伐日本島的太平軍指揮官得到江戶幕府投降的訊息後，非常高興，迅速接納了江戶幕府的投降，並以他們的名義募集了一批日本足輕潰兵和浪人武士，組成了兵進日本島的先鋒炮灰。
江戶幕府雖然投降了，但日本島上有大量獨立自主的大名封建主，這些人可不會一股腦的投降太平軍。
果不其然，太平軍接下來的進展並沒有想象中那麼順利，日本江戶幕府一投降，在京都作為吉祥物的日本天皇頓時如同吃了大『藥』一般，發表了一連串誓死抵抗的‘聖旨’，大肆拉攏不願意被漢人奴役的地方大名和那些頑抗的武士。
佔據了大和民族獨立自主大義名分的日本天皇，屬實收攏了一把權勢，甚至有隱隱將江戶幕府取而代之的意思！
日本島上的不少大名就是一群土包子，對外界的資訊來源十分匱乏，與江戶幕府完全沒有可比『性』，所以他們根本不瞭解太平軍的強大，自然而然的，抵抗的十分起勁。
只可惜，日本天皇大權在握的享受不到一年時間，就被太平軍組建的幕府傀儡軍團打到了京都……
此時，幕府傀儡兵團的各類足輕已經超過萬人，絕大多數都裝備著日本人自己的鐵炮（不帶火繩的那種更新版），至於支援天皇的日本地方大名，被車飛了三分之二，剩下三分之一基本上都投降了……
日本天皇本來也想投降的，只是太平軍有了幕府這個鐵桿日『奸』，已經不需要一無是處的日本天皇了，所以，天皇必須死！
