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上的其他人，決定自己暫時不離開母體。
飛船那邊似乎因為史密斯的失敗，那些機械八爪魚失去了新的命令，在已經存在的那些機械八爪魚被全部幹掉後，就沒有新的機械八爪魚再來了，因此船員們其實還是很安全的。
其他兩個地球女人也成功脫離了母體，回到了飛船上。
進出過母體後的三個地球人，似乎隱隱有所變化，與這個《駭客帝國》世界更契合了一些……
另一方面，在錫安虛擬世界中的一處隱秘地點中，一個血繭開始縮小並變成了一顆蛋，其中隱隱傳出心跳聲，似乎有一個了不得的生命即將產生。
其他幾個地球人也全部都在這裡，只是這些人不得不被機器大帝抽血做實驗，一個個都被折磨得生不如死。
可惜，這些人之前戰鬥時一個個都大招消耗盡了，最後只能夠被機器大帝抓走，但至少對他們來說活著就算不錯的了。
機器大帝正因為看到了血繭變成了蛋，與其意志相連的母體之父也就同時知道似乎事情有了進展，自然全力在觀察這邊的情況，否則當時尼奧那邊未必就能夠那麼輕鬆了吧。
眼前，似乎這顆蛋的變化越來越明顯，連使用地球人的血液做的一些實驗也有了一些進展。
這讓母體之父也完全無法分心他顧，連留在母體中的尼奧一時也真的不去管了。
至於母體之母，說實在的，她有著什麼新的心思和計劃，連母體之父也未必全然清楚。
作為一個後來者，最後能夠被母體之父承認，母體之母絕不當被小看。
實際上，母體之母對於機器大帝現在正在做的實驗還是很感興趣的，只是她也有著自己的想法。
與母體之父要全盤考慮不同，她關注的一直都只是尼奧。
作為一手製造了救世主計劃的她，現在對於尼奧身上的變化，產生的興趣遠遠超過了母體之父了。
對於似乎因為救人而選擇暫時停留在母體的尼奧，母體之母不知不覺中就已經採取了新的行動。
母體之母的做法，從來都是一種，就是讓別人來找她。
她擁有近乎預知的可怕計算力，能夠準備的透過種種意外來達到自己的目的。
尼奧在母體中找到的臨時住所周圍，或多或少的出現了種種小問題，他收到了來自於母體之母的暗示。
尼奧現在在母體之中也覺醒成功，成為真正的救世主，某些只在錫安中可以使用的力量，現在也一併可以在母體中用了。
說到底，根據電影原著的設定來說，錫安其實本來是母體的一個系統備份，後來才演化變成了那個錫安。
劉結草創造了這個世界後，這個世界的生命才剛剛開始。
不過，“歷史”仍舊存在於那裡，這些都是不容改變的“事實”。
尼奧在母體中同樣擁有了近乎作弊的計算力後，他很容易就分析出那些暗示中的含義。
母體之母，在現在雖然知道了許多，但仍舊有許多不知道的尼奧那裡，她也僅僅是祭師，有可能是屬於母體一邊，不能完全信任的存在，如此而已。
對於想要知道某些真相的尼奧來說，他本來就是想要再見一次的，現在這也許正是一個時機。
只是，那個人怎麼辦？
對於無論如何也不醒過來的那個人，尼奧只覺得頭疼。
已經幾天了，這個人居然能夠不飲不食還沒有發生任何問題，現在傻瓜也能夠完全確定這個人不是常人了。
只是，就這樣放著嗎？尼奧可不甘心，他總覺得若是錯過了這個人，以後恐怕就有**煩。
正當尼奧猶豫不決時，那個人的附近突然莫明開啟了一道門，從裡面走出來了三個人類。
這三個人看上去與母體中的這個時代格格不入，與錫安中的時代也格格不入，就好像不是這個世界的人一般。
那三人看到尼奧後就是一愣，再看到某個昏迷不醒的人時，又露出驚容，似乎是認識這個人一樣。
“浦飯結草，你這傢伙快醒一醒。”三人中有一人使勁的搖動躺著的那個人大喊大叫道。
好吧，事實上除了浦飯幽助，其他人還真沒多少人知道劉結草的另一個名字吧。
其他跟來的兩人，也自然是飛影和藏馬。
尼奧誤以為能夠在母體這種虛擬世界中表現出特殊的人，必定是程式，甚至還是母體方面的程式。
所以，面對那三個人，尼奧一直是報著戒備的心理
