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波風水門並沒有直接把這件事情告訴千手繩樹，一來是他不知道該怎麼說明，畢竟就連他也不知道宇智波斑想要怎麼做，二來是宇智波斑的身份他不敢讓任何人知道，雖然他說出去，可能都沒有幾個人會相信，不是不信任千手繩樹，只是有些麻煩的事情，波風水門也不想把他拖進來，還不如不讓他先知道。
緊接著，波風水門就有開始忙碌起來了，有了之前的記憶，他對於處理這些公務是越發的得心應手，但他手中可有的人不太多，依然有很多事情需要他親力親為，所以他這些日子他也很忙，這也就讓他忽略了千手繩樹的不正常。
等到波風水門意識到不對的時候，事情已經發展到了一個很嚴重的地步，就連已經在家裡安享晚年的三代火影都出來了。
事情發生的很突然，波風水門接到暗部傳來的訊息的時候，三代火影已經把事情解決了。
“到底是怎麼回事？”匆匆趕來的波風水門看著面前一臉愁容的三代火影問道。
三代火影抽了一口煙，沉默了一會兒才說道：“老夫早就知道他是一個很有野心的人，卻沒想到他竟然會做人體實驗，研究禁術。”
波風水門倒吸了一口冷氣，他倒不是驚訝這件事情，而是因為他竟然忘記了這麼重要的事情，他的記憶雖然恢復了，但太過繁雜，而這些日子太過安逸的生活讓他完全失去了警惕心。
“這件事情到底和繩樹有什麼關係？”波風水門皺著眉頭，不知道為什麼，他突然有了不好的預感。
“我不知道大蛇丸和他有什麼交易，他竟然把初代火影的細胞交給了他，大蛇丸試圖用初代火影的細胞創造出能夠使用木遁的嬰兒。”三代火影說到這裡，重重的嘆了一口氣。
波風水門一瞬間就明白了千手繩樹為什麼和大蛇丸合作了，一切都是因為玖辛奈，他需要有能使用木遁的忍者，所以沒有經受住大蛇丸的誘惑，把初代火影的細胞交給了他。
但波風水門並不怪他，千手繩樹只是暫時失去了理智，就算他不跟大蛇丸合作，他也有辦法弄到初代火影的細胞，畢竟他所經歷過的那一次，大蛇丸就不知道從哪裡弄來了初代火影的細胞。
不過，這不代表波風水門就不生氣，他都說過會幫他想辦法了，結果千手繩樹轉身就把自己賣給了大蛇丸，他就算不為自己想想，也應該想想玖辛奈，用人體做實驗，私下研究□□，這兩條可是最大的禁忌，一旦這些訊息被洩露出去了，村子裡的人會怎麼看他們？
波風水門的表情有些難看，不過他一直沒有說話，九尾的事情他暫時也不打算告訴三代火影。
三代火影看了他一眼，誤以為他是因為自己這次處置大蛇丸的事情繞過了他，而有些不高興，便說道：“水門啊！這次的事情我親自出手了也是迫不得已。”大蛇丸就算犯了再大的錯誤，也是他的學生，他本應該出手殺了他，但最後他還是心軟放過了他。
波風水門微微一笑，說道：“您多慮了，這件事情我本來就不應該出面，無論您作出了什麼決定我都尊重。”大蛇丸畢竟是他的長輩，他雖然是火影，但在這件事情中也處在一個極為尷尬的地方。
三代火影知道波風水門是真的不在意這件事情，也就放心了，只是說道：“這件事情你也不要怪罪繩樹了，他一定有什麼不得已的原因才這麼做的。”
波風水門微微頷首，說道：“我知道，不過有些事情我還是希望找他問清楚。”
“他現在被關在暗部的地下室裡，你去看看他吧！至於，大蛇丸，就把他定性為叛忍吧！”三代火影有些惆悵的說道。
波風水門又和三代火影說了幾句話，就去看千手繩樹了，他這次犯的錯誤說大不大說小不小，他雖然沒有參與研究，但他給大蛇丸提供了初代火影的細胞，一個不留神可能就會成為有心人的把柄，幸好三代火影處理的比較及時，外人根本就不知道大蛇丸叛逃的這件事情還和他有關係。
但他們能救千手繩樹一次，不可能每次都救他，如果他在這麼控制不住理智，最後肯定會害了他自己，所以波風水門的心情實在是說不上好，他肯定是要懲罰他的。
看守千手繩樹的正好是宇智波帶土，穿著一身暗部衣服的他靠在牆上，目光冰冷的看著他，說道：“我沒想到你竟然會這麼蠢，那個大蛇丸就是一條能把人咬死的毒蛇，你竟然還敢跟他合作，幸好這次的事情沒有牽連到我的老師，不然我一定不會放過你。”
千手繩樹此時的表情萎靡不振，身上的衣服凌亂，看起來十分的狼狽
