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身在濟南和邢臺的馮國璋及曹錕在接到南京政府的最後通牒之後猶豫了，但是兩人卻在最後關頭都沒有按照北伐軍的要求率部出城無條件投降，原因是他們自認為手上還有兵權，而且還有不少兵力，應該得到很到的待遇，而不是無條件投降，就連閻錫山這等牆頭草都能夠得到款待，他們為什麼就要無條件投降？因此兩人心裡頗為不平衡，決心要與北伐軍死戰到底。通牒的時間到了之後，無論是蔡國棟還是張孝準都準備指揮部隊分別向馮國璋和曹錕發起了最後的進攻。
9月19日，東西兩個戰場再次爆發大戰，鋪天蓋地的炮火籠罩著兩個戰場，北伐軍氣勢如虹，而北洋軍則士氣低迷，戰鬥意志不堅，這仗如何打得贏？不到兩日工夫，馮國璋部和曹錕部則相繼潰敗，兩人被裹入潰兵之中四處逃竄，北伐軍隨即揮兵追擊，不久，兩人先後被擒，北伐戰爭至此結束，北洋集團正式被掃入歷史的塵埃之中。
隨著馮國璋和曹錕被擒的訊息傳出之後，那些遺老遺少們徹底失望死心了，就連被軟禁的袁世凱、徐世昌和段祺瑞也彷彿蒼老了許多。
北洋政府覆滅之後，國家總不能一直沒有政權，不能沒有總統或元首處理國家大事，蕭震雷這邊還沒有想著要重新組建政府的事情，反而是在京師的臨時參議院的議員們開始想這問題。並且積極籌備起來。
現在誰都清楚，新總統非蕭震雷莫屬了，其他任何人都沒有他有資格。就連孫文也不例外，孫文只是民黨理事長，民黨的黨員雖然不少，可與其他政治勢力相比也沒有多少優勢，這其中鐵血黨在各省的黨員總和比民黨都還要多，如果重新選舉參議院議員，民黨還不一定能夠拼得過鐵血黨。雖然民黨中人還有不少人掌握的兵權。但相比蕭震雷的勢力卻差得太遠。
9月22日，以張謇、嚴復等為首的立憲人士、以章太炎、蔡元培為首的光復會人士以及以伍廷芳等各政治勢力的首腦人物同時向南京發來電報。請蕭震雷北上京師出任臨時大總統並商議組建新政府事宜。
蕭震雷接到各方來電之後一一回復，稱自己年少無知，資歷尚淺，德才缺失。聲望低微，尚不足以出任臨時大總統一職，請諸公另選賢能。
蕭震雷婉拒臨時大總統一職的訊息傳揚開來之後，社會各界立即對蕭震雷刮目相看，至少在很多人看來，蕭震雷雖然少年得志，卻是老成持重，很多在政治上經營多年的老傢伙人都比不上他，而他現在又婉拒了臨時大總統的職務。由此可見此人卻不像某些人死死地盯著大總統那個職位，一時間社會各界諸多名流和聞人都對蕭震雷好感上升。
可臨時參議院那幫人卻很清楚，新政府如果沒有蕭震雷在。如果新總統不是蕭震雷，絕對會玩不轉，首先就是沒錢，再者沒有有勢力有兵權的人物坐鎮，地方上沒有誰會給中樞政府的面子，孫文雖然聲望夠高。但是從南京臨時政府的成立和撤銷這段時間內就可以看出孫文根本就玩不轉總統的這個職位。
隔天，各方面又向蕭震雷發來電報。再次邀請他北上京師出任臨時大總統一職，並就新政府成立事宜與各界相商。蕭震雷接到電報之後再次一一回復婉言拒絕了，並且向臨時參議院推舉孫文接任臨時大總統一職。
蕭震雷的這些電報發出去之後，參議院內的民黨人士倒是不少同意由孫文接任臨時大總統一職，但是參議院內的其他政治勢力卻都不同意，而且民黨內部意見並不統一，有些人甚至懷疑宋教仁被刺一案與孫文不無關係，因此推舉孫文為臨時大總統的事情只能作罷。
這時參議院內有議員說蕭震雷之所以不願意出任臨時大總統一職，是不是因為他不願意把首都設在京師，而是要設在南京呢？眾人聞言一想還真有這個可能，於是參議院眾人各勢力代表們又紛紛向南京發電，表示參議院願意將首都設在南京，蕭震雷可以就在南京宣誓就職上任。
已經連續三次邀請了，蕭震雷感覺應該夠了，再這樣幹下去就可能會被人說成矯情，於是回電表示受各方抬愛，盛情難卻，勉力接受臨時大總統一職，並且表示首都依然設在京師，自己不日即將北上赴任。
蕭震雷接受邀請即將北上赴任臨時大總統一職的訊息經過新聞媒體的訊息傳出之後，頓時各地歡騰，特別是華東四省和已經被光復的湖北、陝西、山西、河北、河南、山東等地各界代表都對蕭震雷表示擁戴。
25日，蕭震雷召集總督府高層和鐵血黨高層開會，商議北上就職事宜，會議決定宋世傑暫時任南京留守，處理華東四省和新光復各省事務，其他人隨他前往京師組建總統
