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休眠一兩年，就會出一次艙，在地下基地中活動一下，並用他安裝在地下基地中，不斷蒐集世界訊息並儲存的記憶庫瀏覽世界上發生的事情。但是之後，休眠的時間越來越長，5年、8年，一直到2038年來臨，他的記憶庫停止運作，無法再蒐集資訊，他知道他預料中的世界末日來臨了，便一口氣休眠了三十多年的時間。一直到2068年，他才甦醒過來，這一次，他再也不會躺進那個休眠艙，他將要前往外面的世界，一個等著他去重塑的世界。
他毀掉了休眠艙，帶著他的記憶庫硬碟，全副武裝地開啟了地下基地的大門。當外界的光芒照射進來的時候，他彷彿剛剛從母體產道滑出的嬰兒一般，睜不開雙眼，心中卻湧動著無比的興奮和喜悅。一切歸零，他將重新開始他的征程。
一切如他所料，外面的世界，是如此的殘破可怕。這是他一手造成的，想到這一點，他就渾身激動得戰慄。這世上再也沒有一個人如他一般，能夠以人類之軀做到這種神明之事。他就是神，他將成為一切的主宰，他比他的父親，比希特勒不知偉大多少倍。
他將永生不滅。
他開始四處征戰，就以他的地下基地為據點，東征西討，以他手中強大的資源，吸引了大量的人投靠他，又以他強大的管理能力，將自己的地盤經營得風生水起，固若金湯。就這樣，他迅速統一了整個舊華夏國土上大大小小的各個勢力，並於2100年，正式建立聯邦，開始了人類的新紀元。
期間，他再度接收到了拉菲努的聲音，原來拉菲努已經來到了陸地之上，他派人秘密接回拉菲努，兩人終於在百年後見到了彼此。可是當時的拉菲努已經相當蒼老，根本不是魯道夫想象中那樣的絕世美人。原本，沉沒的亞特蘭蒂斯大陸在巨型磁歐石的作用下與天外巨怪融為一體，是能夠永葆其內的人青春永駐的，就像休眠艙一樣，其內的人都處在休眠的狀態中。但是拉菲努不一樣，她的思維最為活躍，活動最為頻繁，為了能和魯道夫加強聯絡，她甚至強迫自己徹底甦醒了過來，因此加快了衰老的過程。
大災後，在被巨型蟲胞噴吐出來著陸時，包裹她的母胎意外破裂，溫養身體的液體流失了大半，也成了她壽命消減的關鍵。魯道夫很著急，拉菲努不能死，他必須找到辦法讓她重回青春，這也關係到他自己的永生計劃。魯道夫一直在注射藥物延長自己的生命，可他依舊擋不住地繼續衰老下去。拉菲努對此卻早有考慮，她將自己的計劃向魯道夫和盤托出，就是要將億萬人精神力量集聚起來，形成蓄魂池，拉菲努便有辦法靈魂脫體，轉胎重生。
於是很快，九神系統在兩人的推動下誕生，拉菲努以她上古文明的龐大積累，為魯道夫創造了必要的條件。這真是一個偉大又兩全其美的發明，一來魯道夫向著夢寐以求的人類思想統一的目標邁出了最關鍵的一步；二來，這也是能夠保佑他與拉菲努永生不死的神器。
然而，拉菲努的精神力量太過龐大了，雖然成功脫體，但卻找不到合適的轉生之軀，只能一直溫養在蓄魂池之中。魯道夫卻沒有那麼強大的精神力量，便率先嚐試尋找身軀轉世。他本來考慮的是轉生到兒子康拉德的身上。但後來放棄了，這一次轉生，只是一次實驗，若是不成功，將康拉德弄死了，可就得不償失了。安德烈斯家族的家業，還要依靠康拉德來維持。何況康拉德的身體也已經衰老，並不合適，當初選擇那麼遲才要繼承人，依舊是計劃趕不上變化。孫子輩裡，魯道夫其實看中了克里埃爾的身軀，他打算等這一次試驗成功，便轉生克里埃爾，他就可以順理成章地繼續統治整個聯邦。他這個孫子克里埃爾太過仁慈，確實不適合做統治者。
然而他沒有想到，原本一切順利進行的計劃，竟然會出了岔子。他剛成功轉生在工人安德魯的身上後，就被牧心盯上了。不得已，他只能低調行事，並思考逃脫之計。工廠大爆炸，他藉此金蟬脫殼。之後幾年時間裡，他做了不少事，比如暗中組建了反叛者組織——星火，是打算放長線釣大魚的，但是失敗了，這個組織成了他人的嫁衣。
此後，ibm5100的秘密也不小心洩露了出去，曾經陪伴了他漫長地下歲月的記憶庫也被盜走。形式急轉直下，魯道夫開始著急了。
牧黎的出現，對他來說是巨大的危機，同時也是巨大的轉機。牧黎的精神力量龐大，代表著她很有可能是唯一能夠承受拉菲努轉世的身軀。牧黎的陣營變換頻繁，一人身兼七種陣營，九神系統卻始終沒有警報。這都是拉菲努在暗中調控的，而並非真的是弗里斯曼的精神改造成功了。拉菲努在九神系統中
