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大不幸。他後來回憶說，幼年在“父母膝下，未得一日承歡”。人常是這樣：生於憂患，死於安樂。憂患既使人痛苦，憂患也激人奮進。幼年的憂患，激勵了康熙奮發學習、自立自強的精神。
康熙身上有著三種血統、三種文化和三種品格。他的父親是滿洲人，祖母是蒙古人，母親是漢族人。他深受祖母的教誨，又向蘇麻喇姑（蘇墨爾，孝莊隨嫁貼身侍女）學習蒙古語，向滿洲師傅學習騎射，跟漢族師傅接受儒家教育。康熙的勇武與奮進，受到了滿洲文化的影響；高遠與大度，得益於蒙古文化的薰陶；仁愛與韜略，來自漢族儒學的營養；後來，他的開放與求新，則是受了耶穌會士西方文化的薰染。康熙帝吸收了中華多民族的、西方多國家的，悠久而又新進、博大而又深厚的文化營養，具有當時最高的文化素質。這為他展現帝王才氣，實現宏圖大業，奠定了基礎。
康熙是中國歷史上少有的嗜書好學的帝王。他5歲入書房讀書，晝夜苦讀，不論寒暑，甚至廢寢忘食。又喜好書法，“每日寫千餘字，從無間斷”。他讀“四書”——《大學》、《中庸》、《論語》、《孟子》，“必使字字成誦，從來不肯自欺”。後來他要求皇子讀書，讀滿百遍，還要背誦，這是他早年讀書經驗的傳承。
康熙繼位後，學習更加勤奮，甚至過勞咯血。他讀書不是為消遣，而是為“體會古帝王孜孜求治之意”，以治國、平天下。他在出巡途中，深夜乘舟，或居行宮，談《周易》，看《尚書》，讀《左傳》，誦《詩經》，賦詩著文，習以為常。直到花甲之年，仍手不釋卷。
康熙帝重視史籍，下令編纂《清文鑑》（滿文字書）、《康熙字典》、《古今圖書整合》、《全唐詩》、《皇輿全覽圖》等，開一代整理與雕印文化典籍之風。他還有《御製文集》（三集）、《御製詩集》、《幾暇格物編》等傳世，留下1147首詩詞。
康熙皇帝對醫學很有興趣，也很有研究。他說自己“年力盛時，能挽十五力弓，發十三把箭”，可見他體格強健、長於弓馬。他也得過幾場大病，使他很早留心醫藥學。康熙40歲那年得了瘧疾，中醫藥未能治癒，耶穌會士洪若翰、劉應進金雞納霜（奎寧）。康熙服用後，很靈驗，病好了。他召見洪若翰、劉應等，在西安門內賞賜房屋，後這裡成為天主教北堂。曹寅得了瘧疾，康熙賜金雞納霜治好了他的病。此後，康熙便對西藥發生興趣，命在京城內煉製西藥，還在宮中設立實驗室，試製藥品，親自臨觀。他提倡種痘以防天花。關外的遊牧族群，特別怕患上天花。順治因患天花而死，康熙也出過天花，臉上留下麻子。清朝在塞外建避暑山莊、木蘭圍場，原因之一是蒙古貴族可以不入京朝覲，減少出天花的機會。他破除因循，推廣種痘，命先給自己子女及宮中女子種痘，還給蒙古49旗及喀爾喀蒙古部民種痘，這就使千萬人因種痘而免去患天花死亡或不死而留下麻子的悲劇。
康熙帝命耶穌會士巴多明將西洋《人體解剖學》書籍翻譯成滿文、漢文。他曾命將一隻冬眠的熊進行解剖，並親自參加。
康熙又喜愛、研習自然科學。他學習和研究自然科學的一個動因，是曾經因為不懂自然科學而在處理政事時遇到困難。欽天監楊光先狀告湯若望，朝廷會議展開了一場關於天算曆法的大爭論。當時，康熙命各位大臣在午門前觀測日影，但在九卿中沒有一個懂得天文曆法的，康熙自己也不懂。他想：自己不懂，怎麼能判斷是非呢？因此發憤學習。
康熙二十七年（1688年）十一月二十八日，白晉、張誠等6位法國科學家在乾清宮受到康熙帝的召見，他們獻上了從法國帶來的30件科技儀器和書籍作見面禮。這些非同尋常的禮品，令康熙帝“天顏喜悅”，當即決定讓他們入宮，擔任自己的科學顧問。從此開始了外國科學家在清朝宮廷從事科學活動長達數十年的局面。
白晉等人入宮後，與康熙相處很融洽，工作也很順利。他們對康熙熱衷科學的態度給予了高度評價，曾把他們的見聞寫在給路易十四（1643～1715年）的報告中。1698年巴黎出版的白晉著《中國皇帝康熙傳》中有過如下記述：
康熙帶著極大的興趣學習西方科學，每天都要花幾個小時同我們在一起，白天和晚上還要用更多的時間自學。他不喜歡嬌生慣養和遊手好閒，常常是起早貪黑。儘管我們謹慎地早早就來到宮中，但他還是經常在我們到達之前就準備好了，他急於向我們請教一些他已經做過的一些習題，或者是向我們提出一些新的問題……
有時他親自用幾何方法測量距離，山
