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全州集結武裝，同時舉行反清起義。
江忠源察覺到將有變故發生，撰寫文章，詳細闡述嘉慶初年官府鎮壓四川和湖南教民起義的始末，勸諭新寧子弟，不要加入起義軍，免得招來殺身之禍。在這種宣傳攻勢下，越來越多的鄉民離開起義隊伍。
江忠源又勸告新寧知縣李博，請他准許棒棒會的會眾自首，並懸賞重金，購買起義領導人的首級。
但是，起義仍然按計劃進行。李輝首先進入新寧城，準備內應。但因走漏風聲，新寧知縣李博張榜通緝，派兵捉拿。
雷再浩迫於壓力，率領部眾在黃背峒和滑溪一帶提前起義。
10月20日，在李博指揮下，江忠源和鹽法道楊炳堃率領兩千名鄉勇，分路圍攻黃背峒，迫使雷再浩的會軍轉移到廣西全州的莊塘，與全州棒棒會首領李世德所部會合，恢復了元氣。
江忠源率領部隊據守要隘，切斷起義軍的供應，並向當局建議，湖南和廣西進行聯合作戰。此後，清軍對起義軍的作戰，基本上按照他的提議進行。
江忠源率領團勇，屢次擊退起義軍的進攻。雷再浩對他恨之入骨，揚言抓到江忠源，要把他生吞活剝。
江忠源的母親聽到訊息，召喚他回家避禍。江忠源笑著對來人說：“毛賊怎能害到我！”不過，他不願讓母親擔心，便回到新寧縣城，協助官員守備。
雷再浩認為在廣西很難站住腳，率部進攻侯家寨，打算攻取新寧，遭到江忠源所部頑強阻擊，未能成功。
一天夜裡，縣城接到報告，說起義軍已經殺到。城內居民驚擾，江忠源睡在縣衙裡，安穩不動。不一會，他部下的團丁抓到起義軍的兩名間諜，綁來見他。知縣要把間諜關進監獄。江忠源說：“不可！現在人心浮動，驚惶失措。只有立刻將他們處死，才能警示亂民。否則會另生變故。”
李知縣聽從了江忠源的意見，城內人心才安定下來。
這時，長寶道楊炳堃和總兵英俊奉令來到新寧鎮壓起義軍，打算調鎮筸兵來增援。江忠源極力反對。他的意思是，對付這一點起義軍，不值得興師動眾。他還說，外來的兵將不可靠，如果小有所失，雷再浩的勢力會更加強盛。
楊炳堃逼問江忠源：“你能獨自擔此重任嗎？”
江忠源回答：“能！”
楊炳堃不再言語。江忠源回到住處，上書論述調兵之難，以及對付雷再浩的容易。他把自己的規劃說得十分明白，於是大家再也不提請求援兵之事。
雷再浩打算轉移到全州、興安和城步三縣交界的五排地區，據險固守。起義軍分為兩支隊伍。雷再浩率領所部與全州人蕭立三的瑤族武裝會合，於10月30日攻克瓜嶺，進佔五排，在周邊的軍事要地分兵駐紮。 txt小說上傳分享
1851年，咸豐元年（5）
11月3日，雷再浩所部在小池大敗廣西清軍，擊斃千總劉春林和外委陳國熊，以及四十多名兵丁。李世德所部起義軍，則於11月9日在鄧家衝被江忠源所部擊敗，李世德自盡。
雷再浩收拾餘部，放棄五排，向廣西境內轉移，於10月19日抵達火把市，突然與清軍遭遇，鏖戰多時，擊斃清軍守備李廷揚以下八十多人。
但是，雷再浩的部隊仍然無法在廣西立足，只得再度進兵新寧，於11月29日黎明從黃瓜衝發起兩路猛攻，進駐深衝峒，迫使駐防清軍退守石田。
雷再浩打算在八峒地區長期固守。楊炳堃和總兵英俊又擔心了，認為八峒地勢險惡，要打攻堅戰，恐怕兵員不夠，必須就地徵兵。江忠源對他們說：“二位大可不必徵兵，只要依靠鄉勇，直搗匪巢，就能平定事端了。”
江忠源請官府知會廣西清軍會攻，自己督率團丁，四面圍逼，截斷了起義軍出兵的道路。起義軍得不到食物，人心浮動。江忠源派本縣的書生蔣啟華，去勸誘起義軍將領陳新進和李尚開投降。蔣啟華密授機宜，讓這兩個叛徒力勸雷再浩放棄八峒，趁著武岡清軍兵力空虛，率部北進，攻取武岡。
雷再浩上了江忠源的當，於12月3日率領一千多名部眾，向毛安轉移。江忠源已經率領一千多名兵勇在這裡預設埋伏，對起義軍發起突襲，重創雷再浩所部。
陳新進和李尚開趁機內應，將雷再浩捆綁起來，送到江忠源的軍營。
第二天，江忠源命令部隊搜山，將李輝抓捕。當時起義軍還有一千多人，江忠源要求官府將其中勇猛多謀者處死。楊炳堃不同意，只殺了幾個人，其餘一律釋放。江忠源嘆
