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不久，臺灣中國醫藥學院內部發生糾紛，一時無人主持。
當時，“###”派了15名董事進行改組，而15名董事中，9人為西醫，由西醫主持中醫藥大學，引起學校一片反對之聲。
在此情況下，蔣介石便找到陳立夫，與之商量說：“中國醫藥學院依照教部之處理辦法，必將垮臺，只有你去，才能挽救，中醫歡迎你，西醫不便反對你，因為你一向為中醫說話，但你是學科學的。
”陳立夫想到要振興中醫藥事業，必須振興中醫藥教育，因此欣然受命，擔任了中國醫藥學院董事長。
陳立夫到任後，解散了原來的董事會選了5箇中醫、5個西醫、5個對學院關心而非醫生者，共15人組成董事會。
院長一職，由於一時無法找到兼中西醫二者之長者擔任，不得已，只好聘請著名教育家鄭通和先生擔任。
在陳立夫指導、鄭通和具體領導下，中國醫藥學院發展很快，他們從香港請來教授，自己編寫教材，克服很多困難。
開始，學院沒有自己的教學醫院。
陳立夫親自找到蔣經國，請予支援，蔣經國即專門撥出款項，建起了教學醫院，有病床800多張，成為臺灣惟一的一所中西醫合作的醫院。
學院也逐步具備了培養本科生、碩士生、博士生的資格，每年畢業700多學生，深受社會歡迎，為中醫、中藥事業的發展準備了人才。
後來，陳立夫繼續努力，在臺灣確立了中醫的法律地位，在臺灣一些公、私立醫院陸續設立中醫部，公勞保中醫也能享用，臺灣衛生署對中醫的態度也逐漸改變。
看到已取得的成就，陳立夫覺得十分欣慰。
（二）翻譯《中國科學技術史》。
《中國科學技術史》是英國科學家李約瑟博士所著，分7卷共12冊，總計850萬字，此書涵蓋了中國古代的自然科技，併兼及中國古代人文和社會科學。
李博士以大量的史實證明，當西方還在黑暗中摸索時，中國的祖先已在數學、天文、地理、物理、化學、生物以及醫學方面做出了相當大的成績。
他認為沒有中國先進的科技對西方的輻射和影響，也就沒有16世紀近代科學在歐洲的發展。
李約瑟博士抗戰時期曾在陪都重慶英國駐華使館中英科###絡處工作，與陳立夫常有交往。
復興文化（2）
李約瑟熱愛中國文化，尤其是對中國古代科技有濃厚的興趣，想寫中國科技史，多次就著書計劃求陳立夫予以幫助。
時任###長的陳立夫鼓勵他寫作，並贈送他一部《漢書》，介紹有關人士和機構，為他調查、寫作提供幫助。
同時，###還推薦了10名中國學者參加工作，特別是金陵女子大學的化學家魯桂珍博士，長期參與合作，後來與李約瑟結為百年之好。
由於中外科學家的鼎力合作，中英聯絡處的研究工作進展十分順利，李約瑟的足跡遍及大後方各主要研究機構，學術文化中心，收集了大量資料，並與中國工匠進行接觸，探討一些器物的製造方法。
這些，都為李約瑟寫作《中國科學技術史》打下了堅實的基礎。
正是由於陳立夫與李約瑟長期形成的這種非同尋常的友誼，所以當陳立夫提出翻譯《中國科學技術史》鉅著時，李約瑟即表示贊成，並至函說明：“翻譯我這本書時，可以不必依其原本厚度，可拆開依照其分量分成幾本。
”陳立夫要譯《中國科學技術史》的訊息傳出後，得到各方大力支援，經濟上得到著名船王董浩雲（董建華之父）、嘉新水泥公司張敏鈺等企業的財力資助，董先拿出4萬美元、張則拿出1萬美元。
陳立夫向蔣介石彙報後，蔣也給予鼓勵，說：“這計劃很好，如經費不足，我會支援你。
”出版上得到臺灣商務印書館王雲五的承諾。
於是，陳立夫很快成立了編譯委員會，由孫科任召集人，王雲五為顧問，委員會下成立由陳立夫為主譯，劉拓為輔助的理事機構，遴選各方專家學者共策進行，這樣，譯事工作全面啟動。
翻譯《中國科學技術史》，這一工程十分浩大，蔚為大觀，參與人數之多、涉獵範圍之廣，均為臺灣過去所沒有。
到1986年，已譯成並出版計14冊。
與此同時，陳立夫又利用各種資料之便，編成了一套《中華科學技藝史叢書》，計25冊，涵蓋我國所有科技如農業、水
