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球都護府，甚至前段時間又多了夏威夷都護府。
這些地方實行的是檢察院、警察廳、法院，以及立法、刑法、司法等現代化制度，需要跟中央完成融合。
但鄧浩楠跟錢謙益商議過後，認為不可以一觸而就，當緩行甚行。畢竟國內的官僚體制根深蒂固，一下子改變恐適得其反。
鄧浩楠想通了其中關節，於是決定打造一個過渡期，一點點將現代化的三權分立制度慢慢滲透進去。
好在明朝末期已經出現了三權分立的雛形，民族、民眾開放性接受西方先進文化思想，使得他們對鄧浩楠的改革方案能夠慢慢接受，逐步改變。
但這也需要時間！
都御使是“糾劾百司，辨明冤枉，提督各道，為天子耳目風紀之司”。十三道監察御史的職責是“察糾內外百司之官邪，或露章面劾，或封章奏劾。在內兩京刷卷，巡視京營，監臨鄉、會試及武舉，巡視光祿，巡視倉場，巡視內庫、皇城、五城，輪值登聞鼓。外巡按，清軍，提督學校，茶馬，巡漕，巡關，攢運，印馬，屯田。師行則監軍紀功”。巡按稱為“代天子巡狩”。官雖不高（正七品），出外巡查時權力卻很大。設通政使司，有通政使、左右通政、左右參議等官，掌管“內外章疏，敷奏封駁之事”。
設大理寺，有卿、左右少卿、左右寺丞等官，掌“審讞，平反刑獄之政令”。與刑部、督察院合稱“三法司”，重大案件由“三法司”會審。
關於翰林院，鄧浩楠進行了較大的改革。
翰林院的名字依然保留，有學士、侍讀學士、侍講學士、侍讀、侍講、五經博士等官。但職能在現有的掌制誥、史冊、文翰、講讀經史、修撰國史等事基礎上，把六科，即吏、戶、禮、兵、刑、工等專業人員的培養納入翰林院。
用鄧浩楠的想法，翰林院從此將成為科學院，培養帝國科技人才，專研西方先進科學知識，全速追趕西方科技水平。
教育是立國之本，鄧浩楠最關心的機關之一。
古代教育由國子監掌控。有祭酒一人、司業一人，五經博士、助教、學正等官。下設五廳（繩愆廳、博士廳、典簿廳、典籍廳、掌饌廳）、六堂（率性、修道、誠心、正義、崇志、廣業）。
鄧浩楠命國子監主管，成立帝國大學，引入荷蘭萊頓大學、格羅寧根大學的全部學科，以及高新聘請這兩座大學的教授、導師和助教到帝國大學授課，並配齊全世界最齊全的教學器材和實驗室。其中實驗室跟翰林院共享，學員從遼東大學和國子監選拔入學。
鄧浩楠任帝國大學名譽校長，原欽天監湯若望任帝國大學首任校長，金尼閣、鄧玉函、羅雅谷、傅泛際、龍華民（N。Longobardi）等任副校長和教授等職務。
鄧浩楠準備用二十年時間，將帝國大學打造成全世界規模最大、教育水平最高的國際化超級大學。
為此，鄧浩楠對帝國大學不惜下血本，先期投資一千萬兩白銀，後期分別從國子監財政預算中每年增加，同時國家財政也會給適當的財政傾斜照顧。
帝**校同時成立，由於之前有了亞東海陸軍軍官學校的基礎，帝**校很容易建立起來。帝**校同樣囊括了亞東海陸軍全部科目，未畢業的亞東軍校學員一律轉入帝**校。鄧浩楠依然擔任榮譽校長，掌控著軍官團，緊緊握住兵權。
當然，亞東軍官學校並沒有裁撤，而是繼續招收學員，跟帝**校形成競爭和攀比，提高軍官對抗拼搏素質。
由於鄧浩楠走精兵之路，因此軍隊中很多軍官都得到機會到軍校進修改造，使得帝**校和亞東軍校的生源不斷。而帝**校的成立，使得原本極少的名額一下子多了起來，更多的軍官、優秀士兵得以有機會學習進步。
軍校的作用是有目共睹的，可以預見軍隊的戰鬥力和軍校培養的人才成正比增長。這不但是鄧浩楠稱霸的籌碼，也是軍人自我提升價值的必由之路。
鄧浩楠掌控了中央之後，第二步就是要掌控地方了。
地方勢力表面上比中央好控制，但事實上強龍不壓地頭蛇的道理亙古不變。鄧浩楠兩面同時下手，一面以朝廷名義直接明令地方官員執行中央命令，一面動用安全域性力量對各個行省官員威逼利誘，使得他們不敢擰成一股繩跟鄧浩楠作對。同時，鄧浩楠改編了各省勤王大軍之後，大多數軍隊都在裁撤範圍內。老弱病殘發放撫卹金回家當農民，青壯依然不少，很多人不懂生活之道，不願意離開軍隊。
為此，鄧浩楠將這些青壯軍隊改
