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遇二分之一的兵權，至於田弘遇能否從這道詔令中嗅到危險的政治訊號，並且從此以後，行為有所收斂或者乾脆跟那幫子勳貴宗親一刀兩斷，那就要看田弘遇的造化了。
拜將沈有容之後，皇帝特意從泰西人開辦的書院中，挑選了幾個西班牙人、葡萄牙人，作為荷蘭問題專家，送給了沈有容，並命令沈有容儘早開拔，收復澎湖。另外，皇帝將王在晉從遼務司調離，改任閩浙總督。
這是朝廷除了四川總督以外的第二位總督官。不過跟四川總督相比，閩浙總督可以追溯到嘉靖朝，當時朝廷為了對付東南沿海的倭寇，設定了閩浙總督一職，但隨著倭寇被平定，也就狡兔死走狗烹了。要知道總督官較之於各省巡撫，擁有著幾乎壓倒性的權力，這種權力對於朝廷的中央集權始終是個威脅，當地方上的事情綏靖以後，總督的官職被免除，也在情理之中。
王在晉算是皇帝一手提拔的心腹，在任職兵部侍郎及遼務司郎中前，王在晉跟沈有容的資歷很像，都是在東南沿海一帶任職，區別只是沈有容任武官，王在晉任文職。所以王在晉對東南的形勢還是有相當瞭解的，對那邊的局面、人員也都熟絡，他的才幹也在任職遼務司的時候得到了檢驗，所以皇帝任用王在晉還是很放心的。
皇帝在打法王在晉趕赴福建前，還特意同他面談了好久。此去東南，王在晉肩負著極大的責任，當然表面上他的工作僅僅是配合沈有容收復澎湖。可假如僅僅是為了這麼一戰，就恢復閩浙總督這麼強勢的一個官職，未免小題大做。所以皇帝明確的給了王在晉三個任務。
近期的任務是協調配合閩浙各地民政、軍政要務，有力的支援沈有容打仗，必要的時候，可以將福建巡撫南居益以及熊文燦市舶司的艦隊都調撥給沈有容指揮。
中期的任務是協調配合閩浙各地，幫助熊文燦彈壓地方，組建市舶司，徵收關稅。
遠期的任務是重新丈量閩浙各地的土地，並普查人口將各地地主、士紳、權貴們兼併、侵吞的土地都給翻出來，並將那些被隱匿或被拘役的人丁解放出來。以備下一步的財政改革之需。
這種土地改革在山東已經初現端倪，雖然山東的土地改革略顯粗糙，極不成熟，但是皇帝已經準備委任一個得力的人手接替趙顏的位子，將山東的土地改革進行到底，沒了魯王一系宗親的阻撓，山東的土地改革是較為輕鬆的。另外，汪文言在河南也正在著手進行土地改革，只是大半年過去了，汪文言似乎並沒有做出什麼成績，這令皇帝有些質疑他當初從東林黨那邊倒戈過來的原因了。
王在晉對於前兩個任務答應的爽快，對於最後一個任務則顯得有些支支吾吾，不過在皇帝的堅持之下，他只能服軟。
皇帝相信有王在晉的協調，以及沈有容、熊文燦和南居益三方的水師力量的集合，定能迅速擊敗荷蘭艦隊，收復澎湖。到時候挾大勝之威望，皇帝大可讓王在晉整編三支水師，組建一支明朝版的福建水師，有如此強大的一支水師艦隊在，無論是震懾四夷，還是給王在晉撐門面，給他壯膽子，都是最有力的支撐。
此間事了，皇帝又將注意力投向西南，從天啟元年開始用兵，現在那裡已經打了兩年多了，孫承宗平叛的物件也從奢崇明，變成了安邦彥。戰場也從四川發展到了貴州。好訊息是兩年多來，西南用兵沒有花費朝廷一粒米，一兩銀，而且四川境內的情況也基本綏靖，奢氏部落的勢力一落千丈。壞訊息是，比奢氏部落更難纏，事業也更大，在當地威望也最深的安氏部落也反叛了朝廷，並一度將貴州境內的官兵打的潰不成軍。當然，西南用兵之所以沒有讓朝廷再調撥糧餉的代價就是川貴兩地的賦稅都被孫承宗截留，充作了兵餉。
為了應對糜爛的西南局勢，皇帝沒有一味的責怪孫承宗，他反而還升了孫承宗的官，從原來的川省總督，做到了川貴總督的位子。
川省本就是國內數一數二的大省，現在又多了一個貴州，孫承宗的權勢可謂是達到了足以裂土封疆的地步，朝堂上下因此也多了不少居心叵測的聲音。
孫承宗也感到自己正被架在火上烤，數次勸說皇帝懲處他，或者削弱他手中的權力。但皇帝不這麼想，他見孫承宗如此識趣，便越發的決定孫承宗忠心耿耿。
西南的亂局雖然愈演愈烈，但總體的形式還是一片大好，因為憑藉著戰亂，皇帝正好實施新政，進行改革。
事實上也正是因為皇帝逼迫著孫承宗在川貴兩地同時進行內政改革，才致使叛軍的氣焰如此囂張。皇帝在經濟方面的改革出動了川貴兩地士紳及部落首
