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寶貝兒！請閉上眼睛，跟著神奇魔法的力量進入魔法世界吧！在世界珠日益繁榮，水晶與夥伴們沉浸於新的魔法探索之際，精靈魔法學院卻陷入了一場前所未有的危機。
三妖后在暗黑魔龍王處鎩羽而歸後，並未放棄她們對魔法世界的統治野心。她們深知，只要水晶和她的夥伴們存在一天，她們的陰謀就難以得逞。於是，三妖后將目光投向了培養眾多魔法精英的精靈魔法學院，企圖從根基上動搖魔法世界的秩序。
三妖后暗中勾結了學院內一些心懷不滿、被黑暗力量誘惑的魔法師，這些叛徒在學院內部悄悄散佈黑暗氣息，蠱惑了部分意志薄弱的學生和教職工。一時間，學院內謠言四起，人心惶惶，原本和諧寧靜的學習與研究氛圍被打破，猜忌與恐懼的陰影籠罩著每一個角落。
魔法學院的守護結界在黑暗力量的侵蝕下逐漸弱化，一些神秘的黑暗生物開始在學院的邊緣地帶出沒。它們身形詭異，散發著腐臭的氣息，所到之處，花草枯萎，牆壁斑駁，彷彿將死亡與衰敗帶到了這片曾經充滿生機的土地。
水晶和她的夥伴們得知學院的危機後，心急如焚。他們迅速趕回學院，決定與三妖后及其爪牙展開一場生死較量。
當水晶踏入學院的那一刻，一股濃烈的黑暗氣息撲面而來。她雖不再有鑲嵌靈珠的魔杖，但體內靈珠的力量與她的意志緊密相連，她目光堅定地說道：“夥伴們，我們不能讓學院毀於一旦，這是我們的家園，也是魔法世界的希望。”
小青渾身雷電環繞，怒吼道：“那些黑暗生物，就交給我來對付，我要讓它們嚐嚐雷電的威力！”說罷，他化作一道藍色的閃電，衝向學院邊緣的黑暗生物群。雷電在他的操控下，如同一把把利刃，瞬間將靠近的黑暗生物劈成灰燼。
小餃子則開啟吞噬魔法，他的身體散發出一股強大的吸力，將那些試圖入侵血院的黑暗氣息紛紛吸入體內。他一邊吞噬，一邊說道：“這些黑暗力量，我會把它們全部淨化！”
小武也不甘示弱，他變大身軀，如同一座移動的堡壘，衝向那些被黑暗力量控制的魔法師。他用堅硬的龜殼抵擋著敵人的攻擊，同時揮動有力的四肢，將靠近的敵人紛紛擊退，為水晶他們開闢出一條前進的道路。
小光則施展出治癒魔法，跟在大家身後，為受傷的夥伴們療傷。她的手中散發出柔和的光芒，光芒所及之處，傷口迅速癒合，疲憊的身軀也重新恢復了力量。
而此時，三妖后在學院深處的遠古祭壇前，念起了邪惡而古老的咒語。隨著咒語的聲音迴盪在四周，祭壇上光芒閃爍，黑暗能量如旋渦般匯聚。突然，雷德王巨大的身影從黑暗旋渦中緩緩浮現。雷德王身形魁梧，全身散發著令人膽寒的黑暗氣息，它的每一步落下，都讓地面為之震動，彷彿帶來了無盡的毀滅力量。
水晶帶領著其他夥伴深入學院內部，尋找三妖后的蹤跡。一路上，他們遭遇了被黑暗力量控制的魔法師的攻擊。這些魔法師原本是學院的精英，但此刻眼神空洞，表情猙獰，手中的魔法變得邪惡而扭曲。
水晶調動體內靈珠的力量，施展出光明魔法，與敵人展開激烈的對抗。她的雙手舞動間，光明靈珠的力量閃耀出聖潔的光芒，驅散了周圍的黑暗。“清醒過來吧，你們被黑暗矇蔽了心智！”水晶大聲呼喊著，試圖喚醒那些被控制的人。
在學院的中心廣場，水晶終於找到了三妖后以及被召喚出的雷德王。三妖后站在雷德王身旁，臉上露出猙獰的笑容，周圍是被黑暗力量束縛的學生和教職工，他們成為了三妖后威脅水晶的人質。
“水晶，你以為你能阻止我們嗎？今天，就是精靈魔法學院的末日，也是你和你的夥伴們的葬身之地！”三妖后張狂地大笑道。
水晶毫不畏懼，她體內的靈珠力量湧動。“你們的陰謀不會得逞，魔法世界的正義必將戰勝邪惡！”
雙方展開了一場驚心動魄的魔法對決。三妖后施展出各種黑暗魔法，黑暗的火焰、毒霧和詛咒如潮水般湧向水晶。水晶則巧妙地運用靈珠的力量，時而用光明抵禦黑暗，時而用火靈珠的火焰反擊，時而用木靈珠召喚出藤蔓困住敵人。雷德王在三妖后的指揮下，揮動著巨大的手臂，向著水晶等人砸來，每一次攻擊都帶著強大的力量，所到之處掀起一陣狂風。
小青在解決了外面的黑暗生物後，也趕來加入戰鬥。他與水晶並肩作戰，雷電與靈珠的力量相互配合，形成了一股強大的攻擊波。小餃子則在一旁守護著被挾持的人質，防止他們受到傷害，並不斷吞噬著戰場上的黑暗力量
